Это команда br_biofetch, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
br_biofetch.rb - клиент biofetch
СИНТАКСИС
br_biofetch.rb [-s сервер] [db] [id] [стиль] [формат]
ОПИСАНИЕ
Эта страница руководства кратко документирует br_biofetch.rb.
br_biofetch.rb это очень простой клиент biofetch. Вы можете подключиться к серверу biofetch и
извлекать записи из базы данных, включая информацию о последовательности.
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
-s Укажите URL-адрес BioFetch CGI (по умолчанию http://bioruby.org/cgi-
bin / biofetch.rb)
-e Используйте сервер EBI в http://www.ebi.ac.uk/cgi-bin/dbfetch
-r Используйте сервер BioRuby по адресу http://bioruby.org/cgi-bin/biofetch.rb
db Имя базы данных. Сюда входят такие параметры, как refseq, genbank, embl, swissprot и т. Д.
Этот вариант зависит от того, какой сервер biofetch вы используете.
id идентификатор записи
стиль «Сырой» или «HTML» (по умолчанию «сырой»)
формат Формат вывода (по умолчанию, fasta, и т. Д.)
Используйте br_biofetch онлайн с помощью сервисов onworks.net
