Это команда cmtk-film, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
film - Исправить чередующееся движение с помощью обратной интерполяции
СИНТАКСИС
фильм Входное изображение Выходное изображение
ОПИСАНИЕ
Этот инструмент разделяет чередующееся входное изображение на проходные изображения, совместно регистрирует их и
восстанавливает изображение с коррекцией движения
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОПЦИИ
Глобальный Инструментарий Варианты (эти общие by ВСЕ СМТК инструменты)
--Помогите
Записать список основных параметров командной строки в стандартный вывод.
--help-all
Записать полный список основных и расширенных параметров командной строки в стандартный вывод.
--вики
Записать список параметров командной строки в стандартный вывод в разметке MediaWiki.
--человек
Напишите исходный код страницы руководства в разметке nroff для стандартного вывода.
--xml
Запишите спецификацию синтаксиса командной строки в разметке XML (для интеграции с слайсером).
--версия
Напишите версию инструментария для стандартного вывода.
- эхо
Записать текущую командную строку в стандартный вывод.
--verbose-уровень
Установите уровень детализации.
--подробный, -v
Увеличить уровень детализации на 1 (не рекомендуется; поддерживается для обратной совместимости).
--потоки
Установите максимальное количество параллельных потоков (для потоков POSIX и OpenMP).
вход Варианты
--padding-значение
Установите значение заполнения для входного изображения. Пиксели с этим значением игнорируются. [Дефолт:
отключен]
Чередование Варианты
--interleave-ось
Определите ось чередования: это сквозное направление сбора данных.
Поддерживаемые значения: «предположение по входу», «аксиальный», «сагиттальный», «коронарный», «чередование-x»,
"interleave-y", "interleave-z", где по умолчанию - "предположение на основе ввода", или используйте один
из следующих:
- угадать из ввода
Угадай по входному изображению [Эта is дефолт]
- осевой, -a
Чередующиеся осевые изображения
- сагиттальный, -s
Сагиттальные изображения с чередованием
- корональный, -c
Чередующиеся корональные изображения
--перемежать-х, -x
Чередование по оси x
--перемежать-y, -y
Чередование по оси y
--interleave-z, -z
Чередование по оси z
--пропуски , -p
Количество чередующихся проходов [Дефолт: 2]
- весовой , -W
Установите вес взноса для пропуска в форме pass: weight.
Движение Коррекция / Регистрация Варианты
--reference-image , -R
Используйте для регистрации отдельное эталонное изображение с высоким разрешением [Дефолт: НИКТО]
--регистрационная метрика
Метрика регистрации для оценки движения путем совмещения изображения с изображением. Поддерживается
значения: «nmi», «mi», «cr», «msd», «cc», где по умолчанию - «msd», или используйте одно из
следующие:
--нми
Используйте нормализованную взаимную информацию для референтной регистрации
--ми Используйте стандартную взаимную информацию для референтной регистрации
--кр Использовать коэффициент корреляции для переадресации в референсную регистрацию
--мсд
Использовать среднеквадратическую разницу для проходной регистрации [Эта is
дефолт]
--cc Используйте кросс-корреляцию для регистрации перехода к ссылке
--import-xforms-путь
Путь к файлу, из которого следует импортировать преобразования между проходами. [Дефолт: НИКТО]
--export-xforms-путь
Путь к файлу, в который нужно экспортировать преобразования между проходами. [Дефолт: НИКТО]
Начальный Объём Впрыск Варианты
- инъекция-ядро-сигма , -S
Стандартное отклонение ядра Гаусса для объемной инъекции, кратное размеру пикселя
в каждом направлении. [Дефолт: 0.5]
- инъекция-ядро-радиус , -r
Коэффициент радиуса усечения инжекционного ядра. Ядро усечено до
радиус сигмы *, где сигма - стандартное отклонение ядра. [Дефолт: 2]
обратный Интерполяция Варианты
- ядро обратной интерполяции
Ядро для реконструкции с обратной интерполяцией Поддерживаемые значения: "cubic",
"linear", "hamming-sinc", "cosine-sinc", где по умолчанию - "cubic", или используйте одно из
следующие:
кубический, -C
Трикубическая интерполяция [Эта is дефолт]
- линейный, -L
Трилинейная интерполяция (быстрее, но менее точно)
--хамминг-синк, -H
Синк-интерполяция с использованием окна Хэмминга
--косинус-синк, -O
Синхронная интерполяция с косинусным окном (самая точная, но самая медленная)
- ошибка четвертого порядка, -f
Используйте для оптимизации ошибку четвертого (а не второго) порядка.
--num-итераций , -n
Максимальное количество итераций обратной интерполяции [Дефолт: 20]
Реконструкция регуляризация Варианты
--l-норма-вес
Установить вес ограничения для регуляризации L-нормы Тихоновского типа (0 отключает ограничение)
[Дефолт: 0]
--без усечения, -T
Отключить усечение региональной интенсивности
Результат Варианты
--write-injection-image
Записать начальное изображение впрыска объема в путь [Дефолт: НИКТО]
--write-images-as-float, -F
Записывать выходные изображения с плавающей запятой [по умолчанию: то же, что и входные]
АВТОРЫ
Торстен Рольфинг, при участии Майкла П. Хасака, Грега Джеффериса, Кэлвина Р.
Маурер, Даниэль Б. Русаков и Ярослав Гальченко
Воспользуйтесь cmtk-film онлайн на сервисах onworks.net
