Это команда mapMers-depth, которую можно запустить в бесплатном хостинг-провайдере OnWorks, используя одну из наших многочисленных бесплатных онлайн-рабочих станций, таких как Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-эмулятор Windows или онлайн-эмулятор MAC OS.
ПРОГРАММА:
ИМЯ
mapMers-depth - сообщить информацию о сопоставлении kmers с последовательностями
СИНТАКСИС
mapMers-глубина {-счет|-глубина|-статистика} -меры МЕРИЛ -m МЕРСАЙЗ -seq ИН.ФАСТА
ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ УСЛУГИ, НЕ ВКЛЮЧЕННЫЕ В ПАКЕТ
Режимы of операция
Для порядкового номера последовательности "s" и позиции в этой последовательности "p":
-счет сообщает количество (c) единственного kmer, которое начинается в позиции (p).
Формат: 'spc'
-глубина сообщает количество (n) кмеров, которые охватывают позицию (p).
Формат: 'spn'
-статистика сообщает минимальное (m), максимальное (M) и среднее (a) количество всех мер, которые охватывают
положение (р). также сообщает общее количество (t) и количество kmers (n)
Формат: 'spm M atn'
Общие
-m МЕРСАЙЗ
-меры МЕРИЛ
Мерил(1) база данных
-seq ИН.ФАСТА
входная последовательность fasta
Используйте mapMers-depth онлайн с помощью сервисов onworks.net
