miconv - Интернет в облаке

ПРОГРАММА:

ИМЯ

miconv - преобразует данные медицинского изображения между форматами.

СИНТАКСИС

Miconv [кредита] []

ОПИСАНИЕ

miconv: преобразует данные медицинских изображений между форматами.

Форматы файлов автоматически идентифицируются по их расширению. Ожидается на
минимум два имени файла / каталога (для входного и выходного файла) в конце
командная строка. Исключением является опция '-l', которая требует только одного
имя_файла / каталог для отображения его содержимого.

Общие опции:
-l: Список разделенных пробелами набора параметров протокола и выходов. Используйте '-l help', чтобы получить
список возможных параметров и «-l all» для вывода всех параметров. Параметр
'выходной-файл' должен быть опущен при использовании этой опции.

-p: Загрузить этот протокол для значений по умолчанию

протокол опции:
-Дата: Дата сканирования [ггггммдд] (по умолчанию = 20140807ггггммдд)

-фп: FOV в направлении фазы [мм] (по умолчанию = 220.0 мм)

-пт: FOV в направлении чтения [мм] (по умолчанию = 220.0 мм)

-фс: FOV в направлении среза [мм] (по умолчанию = 5.0 мм)

-номер: Количество последовательных измерений (по умолчанию = 1)

-nx: Количество точек в направлении чтения (по умолчанию = 128)

-ни: Количество точек в направлении фазы (по умолчанию = 128)

-nz: Количество точек в направлении среза (по умолчанию = 1)

-рождение: Дата рождения пациента [ггггммдд] (по умолчанию = 00000000ггггммдд)

-пид: Уникальный идентификатор пациента (по умолчанию = Неизвестно)

-pname: Полное имя пациента (по умолчанию = Неизвестно)

-псекс: Пол пациента (параметры = MFO, по умолчанию = O)

-вес: Вес пациента [кг] (по умолчанию = 50.0 кг)

-ученый: Имя ученого (по умолчанию = Неизвестно)

-сд: Расстояние между срезами (от центра к центру) [мм] (по умолчанию = 10.0 мм)

-серд: Описание серии (по умолчанию = Неизвестно)

-серно: Серийный номер (по умолчанию = 1)

-st: Толщина среза [мм] (по умолчанию = 5.0 мм)

-шпилька: Описание исследования (по умолчанию = неизвестно)

-tcname: Имя передающей катушки (по умолчанию = Неизвестно)

-чай: Время до эха последовательности [мс] (по умолчанию = 80.0 мс)

-время: Время сканирования [ччммсс] (по умолчанию = 091009ччммсс)

-тр: Время между последовательными возбуждениями [мс] (по умолчанию = 1000.0 мс)

Файл читать опции:
-cplx: Рассматривать данные как сложные и извлекать данный компонент (параметры = нет абс.
imag, по умолчанию = нет)

-дс: Индекс набора данных для извлечения при чтении нескольких наборов данных

-фильтр: Читать только те наборы данных, параметр протокола которых 'key' содержит строку
'значение' (дается в формате 'ключ = значение')

-fmap: Для уменьшения использования памяти сохраняйте отображение файлов после чтения (сырых) данных, но при записи
в массив приведет к сбою

-jdx: Если присутствует несколько массивов JDX, выберите это

-диалект: Читать данные с использованием заданного диалекта формата. (по умолчанию диалект отсутствует)

-рф: Формат чтения, используйте его для переопределения расширения файла (options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, по умолчанию = автоопределение)

-пропускать: Пропустить это количество байтов перед чтением необработанных данных (по умолчанию = 0)

Файл записывать опции:
-приложить: Добавить в существующий файл, только для необработанных данных

-fnamepar: Разделенный пробелами список параметров протокола для включения при создании уникальных
имена файлов

-без масштаба: Не изменять масштаб значений при сохранении целых чисел.

-Трещина: Принудительное разделение пар протокол-данные на отдельные файлы.

Типа: Тип представления изображения (опции = автоматическое с плавающей запятой double s32bit u32bit s16bit
u16bit s8bit u8bit, по умолчанию = автоматически)

-wдиалект: Записывать данные, используя заданный диалект формата. (по умолчанию диалект отсутствует)

-вф: Формат записи, используйте его для переопределения расширения файла (options = autodetect 3db analysis asc
coi dat dcm double float gz hdr idx ima interfile jdx mag mhd nii ph png pos pro
reg s16bit s32bit s8bit smp u16bit u32bit u8bit, по умолчанию = автоопределение)

-wp: Сохраните протокол отдельно в этот файл.

Фильтры:
-выровнять : Выровнять данные по геометрии (расположению вокселей)
внешний файл

-автомаска : Создать маску с использованием автоматического порога на основе гистограммы

-кластер : Создание кластеров ненулевых вокселей соседних / следующих соседей, отсортированных по размеру

-свернуть <ядро свертки (Gauss NoFilter Triangle Hann Hamming CosSq Blackman
BlackmanNuttall Exp), диаметр ядра [мм]>: Свертка в пространственных измерениях

- детренд <Количество низкочастотных компонентов, подлежащих удалению, нулевое среднее результирующего
timecourse>: убрать медленный дрейф с течением времени

-редактировать <Строка позиции/диапазона в формате (timeframe,slicepos,phasepos,readpos),новое значение
of voxel>: редактировать значения отдельных вокселей

-маска гена : Создать маску, включающую все воксели со значением
в заданном диапазоне

-изотроп : сделать воксели изображения изотропными посредством интерполяции (изображение
геометрия не изменится)

-НЧ : Фильтрация нижних частот

-Максимум : Обрезать все значения выше максимального значения

-максип : Выполнить проецирование с максимальной интенсивностью
по заданному направлению

-слияние : Объединение наборов данных в один набор данных путем расширения измерения времени.

-мин : Вырезать все значения ниже минимального значения

-минип : Выполнить проецирование с минимальной интенсивностью
по заданному направлению

-ноНаН : Заменяет каждое NaN заданным значением

-пфлип : Перевернуть данные по фазе

-пранг : Выбрать диапазон в
фазовое направление

-проект : Выполнить среднее прогнозирование на заданное
направление

-квантильная маска : Создать маску, включающую все воксели выше данного дробного
порог

-ресемпл : Временное изменение размера данных изображения

-размер : Пространственное изменение размера данных изображения

-резать : преобразовывает изображение к заданному
ориентация

-rflip : Перевернуть данные в направлении чтения

гниль : Вращение в плоскости

-ранжировать : Выбрать диапазон в
читать направление

-масштаб : Масштабировать значения изображения

-флип : Отразить данные в направлении среза

-сдвиг <сдвиг readDirection [пиксель], сдвиг PhaseDirection [пиксель], сдвиг SliceDirection
[пиксель]>: сдвиг данных по пространству

-слайстайм : Правильно для
разные моменты времени получения срезов

-сплейс : соединяет
изображение в заданном направлении

-оранжевый : Выбрать диапазон в
направление среза

-свопдим <[rps] [-], [rps] [-], [rps] [-]>: поменять местами / отразить размеры, указав направление
тройной с добавленным дополнительным знаком отражения

-плитка : Объединение фрагментов в квадратное 2D-изображение

-странный : Выбрать диапазон в
направление времени

-сдвиг : Сдвиг данных во времени

-типмакс : Вырезать все значения выше максимума определенного типа данных

-typemin : Вырезать все значения ниже минимума определенного типа данных

-использовать маску : Создать 1D набор данных, включая все значения в маске из файла

Другие контрактные услуги опции:
-v или для отладки / отслеживания всех компонентов или одного
компонент соответственно. Возможные значения для уровня журнала: 0 (noLog), 1 (errorLog),
2 (журнал предупреждений), 3 (журнал информации).

-h, --Помогите, -Помощь, --версия : Распечатать текст справки или информацию о версии

Поддержанный файл расширения (форматы):
3 дБ (двоичные данные Iris3D)

анализировать
(NIFTI / ANALYZE, диалекты: fsl)

asc (ASCII, диалекты: tcourse)

coi (наборы данных JCAMP-DX)

dat (матрица 2D данных Matlab ascii)

dcm (DICOM, диалекты: siemens)

двойной (двойные исходные данные)

float (необработанные данные с плавающей точкой)

gz (контейнер GNU-Zip для других форматов)

hdr (Interfile, диалекты: нейростат)

hdr (НИФТИ / АНАЛИЗ, диалекты: fsl)

idx (3D-индексы ненулевых в ASCII)

ima (DICOM, диалекты: siemens)

межфайловый
(Интерфайл, диалекты: нейростат)

jdx (формат изображения JCAMP-DX)

mag (DICOM, диалекты: siemens)

mhd (метаизображение)

nii (NIFTI / ANALYZE, диалекты: fsl)

ph (DICOM, диалекты: siemens)

png (переносимая сетевая графика)

pos (xy позиции ненулевых в ASCII)

pro (протоколы измерений ODIN)

регистр (Ansoft HFSS ASCII)

s16bit (16-битные необработанные данные со знаком)

s32bit (32-битные необработанные данные со знаком)

s8bit (8-битные необработанные данные со знаком)

smp (наборы данных JCAMP-DX)

u16bit (16-битные необработанные данные без знака)

u32bit (32-битные необработанные данные без знака)

u8bit (8-битные необработанные данные без знака)

Используйте miconv онлайн с помощью сервисов onworks.net