นี่คือคำสั่ง bp_chaos_plotp ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
bp_chaos_plot - พล็อตความโกลาหลจากลำดับ DNA และ RNA
เรื่องย่อ
bp_chaos_plot.pl -i/--input=INPUTFILE -f/--format=SEQFORMAT
-o/--output=OUTPUTFILE -g/--graphics=รูปแบบกราฟิก
-w/--ความกว้าง=WIGHT -h/--ความสูง=HEIGHT
DESCRIPTION
สคริปต์นี้สร้างไฟล์รูปภาพโดยใช้ไลบรารีรูปภาพ GD เพื่อแสดงภาพนิวคลีโอไทด์
ลำดับโดยใช้พล็อตเรื่องโกลาหล
OPTIONS
รูปแบบกราฟิกที่ใช้ได้ในปัจจุบันคือ gd, gd2, png, wbmp, jpeg และ gif
ขนาดเริ่มต้นของไฟล์รูปภาพคือ 600x400
อินพุตลำดับสามารถจัดเตรียมได้โดยใช้หนึ่งในสามวิธี:
อาร์กิวเมนต์ที่ไม่มีชื่อ
bp_chaos_plot ชื่อไฟล์
ชื่ออาร์กิวเมนต์
bp_chaos_plot -i ชื่อไฟล์
อินพุตมาตรฐาน
bp_chaos_plot < ชื่อไฟล์
การตอบรับ
จดหมาย รายการ
ความคิดเห็นของผู้ใช้เป็นส่วนสำคัญของวิวัฒนาการของโมดูลนี้และโมดูล Bioperl อื่นๆ ส่ง
ข้อคิดเห็นและข้อเสนอแนะของคุณ ควรไปที่รายชื่อผู้รับจดหมายของ Bioperl การมีส่วนร่วมของคุณ
เป็นที่ชื่นชมมาก
[ป้องกันอีเมล] - พูดคุยเรื่องทั่วไป
http://bioperl.org/wiki/Mailing_lists - เกี่ยวกับรายชื่อผู้รับจดหมาย
การรายงาน Bugs
รายงานจุดบกพร่องไปยังระบบติดตามจุดบกพร่องของ Bioperl เพื่อช่วยเราติดตามจุดบกพร่องและข้อบกพร่องเหล่านั้น
ปณิธาน. สามารถส่งรายงานข้อบกพร่องผ่านทางเว็บ:
https://github.com/bioperl/bioperl-live/issues
ผู้แต่ง - เจสัน สตาจิช
อีเมลล์ [ป้องกันอีเมล]
ประวัติ
รหัสนี้ใช้รหัส EMBOSS C สำหรับ chaos.c โดย Ian Longden รวมอยู่ด้วย
เอกสารจากรหัส EMBOSS:
ความโกลาหลก่อให้เกิดความโกลาหล แอปพลิเคชันดั้งเดิมเป็นส่วนหนึ่งของจีโนม ACEDB
แพ็คเกจฐานข้อมูล เขียนโดย ** Richard Durbin (MRC LMB, UK) [ป้องกันอีเมล]และ
Jean Thierry-Mieg (CRBM ดู CNRS ฝรั่งเศส) [ป้องกันอีเมล]
ใช้ bp_chaos_plotp ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
