mapMers-depth - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

mapMers-depth - รายงานข้อมูลเกี่ยวกับการทำแผนที่ kmers กับซีเควนซ์

เรื่องย่อ

mapMers-ความลึก {-นับ|-ความลึก|-สถิติ} -เมอร์ เมอรีล -m เมอร์ไซส์ -seq ใน.ฟาสต้า

OPTIONS

โหมด of การดำเนินการ
สำหรับลำดับลำดับ 's' และตำแหน่งในลำดับนั้น 'p':

-นับ รายงานการนับ (c) ของ single kmer ที่เริ่มต้นที่ตำแหน่ง (p)

รูปแบบ: 'spc'

-ความลึก รายงานจำนวน (n) ของกิโลเมตรที่ครอบคลุมตำแหน่ง (p)

รูปแบบ: 'spn'

-สถิติ รายงานจำนวนต่ำสุด (m) สูงสุด (M) และค่าเฉลี่ย (a) ของ mers ทั้งหมดที่ครอบคลุม
ตำแหน่ง (p) รายงานจำนวนรวม (t) และจำนวนกิโลเมตร (n)

รูปแบบ: 'spm M atn'

General
-m เมอร์ไซส์

-เมอร์ เมอรีล
เมอรีล(1) ฐานข้อมูล

-seq ใน.ฟาสต้า
ลำดับอินพุตที่รวดเร็ว

ใช้ mapMers-deep ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net