EnglishFrenchGermanItalianPortugueseRussianSpanish

ไอคอน Fav ของ OnWorks

maskfeate - ออนไลน์ในคลาวด์

เรียกใช้ maskfeate ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks ผ่าน Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

นี่คือคำสั่ง maskfeate ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS

โครงการ:

ชื่อ


maskfeat - เขียนลำดับด้วยคุณสมบัติที่ปิดบัง

เรื่องย่อ


maskfeat -ลำดับ seqall [ประเภท เชือก] [-tolower ข้อศอก] -maskchar เชือก -outseq seqout

maskfeat -ช่วยด้วย

DESCRIPTION


maskfeat เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Edit,Feature tables"

OPTIONS


อินพุต ส่วน
-ลำดับ seqall

เพิ่มเติม ส่วน
ประเภท เชือก
โดยค่าเริ่มต้น คุณลักษณะใดๆ ในตารางคุณลักษณะที่มีประเภทเริ่มต้น 'ทำซ้ำ' จะถูกปิดบัง
คุณสามารถตั้งค่านี้เป็นคุณลักษณะประเภทใดก็ได้ที่คุณต้องการปิดบัง ดู
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ สำหรับรายการประเภทคุณลักษณะ EMBL และดู
ภาคผนวก A ของคู่มือผู้ใช้ Swissprot ใน http://www.expasy.org/sprot/userman.html
สำหรับรายการประเภทฟีเจอร์ Swissprot ประเภทอาจถูกไวด์การ์ดโดยใช้ '*' ถ้า
คุณต้องการปิดบังมากกว่าหนึ่งประเภท แยกชื่อด้วยการเว้นวรรคหรือเครื่องหมายจุลภาค เช่น:
*UTR ซ้ำ* ค่าเริ่มต้น: ซ้ำ*

-tolower ข้อศอก
ภูมิภาคสามารถ 'ปิดบัง' โดยการแปลงอักขระลำดับเป็นตัวพิมพ์เล็กบางส่วน
โปรแกรมที่ไม่ใช่ EMBOSS เช่น fasta สามารถตีความสิ่งนี้ว่าเป็นพื้นที่ปิดบัง ลำดับคือ
ไม่เปลี่ยนแปลงยกเว้นกรณีเปลี่ยน คุณอาจต้องการให้แน่ใจว่าลำดับทั้งหมด
เป็นตัวพิมพ์ใหญ่ก่อนที่จะปิดบังภูมิภาคที่ระบุเป็นตัวพิมพ์เล็กโดยใช้
ธง '-อาหารค่ำ' ค่าเริ่มต้น: N

-maskchar เชือก
ตัวละครที่จะใช้ในการปิดบัง ค่าเริ่มต้นคือ 'X' สำหรับลำดับโปรตีน 'N' สำหรับนิวคลีอิก
ลำดับ หากตั้งค่าอักขระตัวพรางเป็นอักขระ SPACE หรืออักขระ null
จากนั้นลำดับจะถูก 'ปิดบัง' โดยเปลี่ยนเป็นตัวพิมพ์เล็ก เช่นเดียวกับ with
ธง '-ตัวพิมพ์เล็ก' ค่าเริ่มต้น: @($(acdprotein)?X:N)

เอาท์พุต ส่วน
-outseq seqout

ใช้ maskfeate ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net


Ad


Ad

โปรแกรมออนไลน์ Linux และ Windows ล่าสุด