นี่คือคำสั่ง maskfeate ที่สามารถเรียกใช้ในผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีของ OnWorks โดยใช้เวิร์กสเตชันออนไลน์ฟรีของเรา เช่น Ubuntu Online, Fedora Online, โปรแกรมจำลองออนไลน์ของ Windows หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ MAC OS
โครงการ:
ชื่อ
maskfeat - เขียนลำดับด้วยคุณสมบัติที่ปิดบัง
เรื่องย่อ
หน้ากาก -ลำดับ ภาคต่อ [ประเภท เชือก] [- ตัวล่าง ข้อศอก] -มาสก์ชาร์ เชือก -outseq ผลสืบเนื่อง
หน้ากาก -ช่วยด้วย
DESCRIPTION
หน้ากาก เป็นโปรแกรมบรรทัดคำสั่งจาก EMBOSS (“ the European Molecular Biology Open
ชุดซอฟต์แวร์”) เป็นส่วนหนึ่งของกลุ่มคำสั่ง "Edit,Feature tables"
OPTIONS
อินพุต ส่วน
-ลำดับ ภาคต่อ
เพิ่มเติม ส่วน
ประเภท เชือก
โดยค่าเริ่มต้น คุณลักษณะใดๆ ในตารางคุณลักษณะที่มีประเภทเริ่มต้น 'ทำซ้ำ' จะถูกปิดบัง
คุณสามารถตั้งค่านี้เป็นคุณลักษณะประเภทใดก็ได้ที่คุณต้องการปิดบัง ดู
http://www.ebi.ac.uk/embl/WebFeat/ สำหรับรายการประเภทคุณลักษณะ EMBL และดู
ภาคผนวก A ของคู่มือผู้ใช้ Swissprot ใน http://www.expasy.org/sprot/userman.html
สำหรับรายการประเภทฟีเจอร์ Swissprot ประเภทอาจถูกไวด์การ์ดโดยใช้ '*' ถ้า
คุณต้องการปิดบังมากกว่าหนึ่งประเภท แยกชื่อด้วยการเว้นวรรคหรือเครื่องหมายจุลภาค เช่น:
*UTR ซ้ำ* ค่าเริ่มต้น: ซ้ำ*
- ตัวล่าง ข้อศอก
ภูมิภาคสามารถ 'ปิดบัง' โดยการแปลงอักขระลำดับเป็นตัวพิมพ์เล็กบางส่วน
โปรแกรมที่ไม่ใช่ EMBOSS เช่น fasta สามารถตีความสิ่งนี้ว่าเป็นพื้นที่ปิดบัง ลำดับคือ
ไม่เปลี่ยนแปลงยกเว้นกรณีเปลี่ยน คุณอาจต้องการให้แน่ใจว่าลำดับทั้งหมด
เป็นตัวพิมพ์ใหญ่ก่อนที่จะปิดบังภูมิภาคที่ระบุเป็นตัวพิมพ์เล็กโดยใช้
ธง '-อาหารค่ำ' ค่าเริ่มต้น: N
-มาสก์ชาร์ เชือก
ตัวละครที่จะใช้ในการปิดบัง ค่าเริ่มต้นคือ 'X' สำหรับลำดับโปรตีน 'N' สำหรับนิวคลีอิก
ลำดับ หากตั้งค่าอักขระตัวพรางเป็นอักขระ SPACE หรืออักขระ null
จากนั้นลำดับจะถูก 'ปิดบัง' โดยเปลี่ยนเป็นตัวพิมพ์เล็ก เช่นเดียวกับ with
ธง '-ตัวพิมพ์เล็ก' ค่าเริ่มต้น: @($(acdprotein)?X:N)
เอาท์พุต ส่วน
-outseq ผลสืบเนื่อง
ใช้ maskfeate ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net
