mia-2dmyoset-all2one-nonrigid - ออนไลน์ในคลาวด์

โครงการ:

ชื่อ

mia-2dmyoset-all2one-nonrigid - การลงทะเบียนแบบไม่เชิงเส้นของชุดภาพ 2 มิติ

เรื่องย่อ

mia-2dmyoset-all2one-ไม่แข็ง -i -o [ตัวเลือก]

DESCRIPTION

mia-2dmyoset-all2one-ไม่แข็ง โปรแกรมนี้ดำเนินการลงทะเบียนแบบไม่เข้มงวดของชุดของ
ภาพที่กำหนดให้ในชุดภาพ ภาพทั้งหมดได้รับการลงทะเบียนกับการอ้างอิงที่กำหนดโดยผู้ใช้รายเดียว
ภาพ.

OPTIONS

ไฟล์-IO
-i --in-file=(อินพุต, จำเป็น); สตริง
ป้อนข้อมูลชุดข้อมูลการกระจาย

-o --out-file=(เอาต์พุต, จำเป็น); สตริง
ชุดข้อมูลการกระจายเอาต์พุต

--ออก-filebase=reg
file name basae สำหรับไฟล์ที่ลงทะเบียนไว้ , file type จะถูกหักออกจาก image
ประเภทไฟล์ในชุดข้อมูลอินพุต

ลงทะเบียน
-k --ข้าม=0
ข้ามภาพที่จุดเริ่มต้นของซีรีส์ข้ามภาพที่จุดเริ่มต้นของ
ซีรี่ย์

-O --optimizer=gsl:opt=gd,ขั้นตอน=0.1
เครื่องมือเพิ่มประสิทธิภาพที่ใช้สำหรับการย่อเล็กสุด

-l --mg-ระดับ = 3
ระดับความละเอียดหลายระดับหลายระดับความละเอียด

-f --transForm=เส้นโค้ง
ประเภทการแปลงประเภทการแปลงสำหรับปลั๊กอินที่รองรับดู
ปลั๊กอิน:2dimage/transform

-r --ref=-1
หน้าต่างอ้างอิง (-1 == ใช้รูปภาพตรงกลาง) กรอบอ้างอิง (-1 == use
ภาพตรงกลาง)

การช่วยเหลือ & ข้อมูล
-V --verbose=คำเตือน
ความละเอียดของผลลัพธ์ พิมพ์ข้อความในระดับที่กำหนดและลำดับความสำคัญที่สูงกว่า
ลำดับความสำคัญที่รองรับเริ่มต้นที่ระดับต่ำสุดคือ:
ข้อมูล - ข้อความระดับต่ำ
ติดตาม - การติดตามการเรียกใช้ฟังก์ชัน
ล้มเหลว - รายงานความล้มเหลวในการทดสอบ
คำเตือน - คำเตือน
ความผิดพลาด - รายงานข้อผิดพลาด
การแก้ปัญหา - ดีบักเอาท์พุต
ข่าวสาร - ข้อความปกติ
ร้ายแรง - รายงานเฉพาะข้อผิดพลาดร้ายแรง

--ลิขสิทธิ์
พิมพ์ข้อมูลลิขสิทธิ์

-h -- ช่วยด้วย
พิมพ์ความช่วยเหลือนี้

-? --การใช้งาน
พิมพ์ความช่วยเหลือสั้น ๆ

--รุ่น
พิมพ์หมายเลขรุ่นและออก

การประมวลผล
--กระทู้=-1
จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผล จำนวนนี้ควรต่ำกว่า
หรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะในเครื่อง (-1:
การประมาณค่าอัตโนมัติ) จำนวนเธรดสูงสุดที่จะใช้สำหรับการประมวลผลนี้
จำนวนควรต่ำกว่าหรือเท่ากับจำนวนคอร์ตัวประมวลผลเชิงตรรกะใน
เครื่องจักร. (-1: การประมาณค่าอัตโนมัติ)

ปลั๊กอิน: 1d/slinebc

กระจก เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่สะท้อนบนขอบเขต

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ทำซ้ำ เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่ซ้ำค่าที่ขอบเขต

(ไม่มีพารามิเตอร์)

เป็นศูนย์ เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไข Spline ที่ถือว่าศูนย์สำหรับค่าภายนอก

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ปลั๊กอิน: 1d/เคอร์เนลเส้นโค้ง

บีสไปลน์ การสร้างเคอร์เนล B-spline พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

d = 3; int ใน [0, 5]
องศาของเส้นโค้ง

ออมม่า การสร้างเคอร์เนล OMoms-spline พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

d = 3; int ใน [3, 3]
องศาของเส้นโค้ง

ปลั๊กอิน: 2dimage/ราคา

lncc สหสัมพันธ์ข้ามทำให้เป็นมาตรฐานในเครื่องพร้อมรองรับการกำบัง, พารามิเตอร์ที่รองรับ
คือ:

w = 5; ใน [1, 256]
ครึ่งความกว้างของหน้าต่างที่ใช้สำหรับประเมินกากบาทที่แปลแล้ว
ความสัมพันธ์

LSD วัดระยะทางที่น้อยที่สุด

(ไม่มีพารามิเตอร์)

mi ข้อมูลร่วมกันตาม Spline parzen พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ตัด = 0; ลอยอยู่ใน [0, 40]
เปอร์เซ็นต์ของพิกเซลที่จะตัดที่ความเข้มสูงและต่ำที่จะลบออก
ค่าผิดปกติ

ถังขยะ = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับภาพเคลื่อนไหว

เคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพเคลื่อนไหว parzen hinstogram สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

rbin = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับรูปภาพอ้างอิง

เคอร์เนล = [bspline:d=0]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพอ้างอิง parzen hinstogram สำหรับปลั๊กที่รองรับ-
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

NCC ความสัมพันธ์ข้ามมาตรฐาน

(ไม่มีพารามิเตอร์)

อึ้ง ฟังก์ชันนี้จะประเมินความคล้ายคลึงของภาพตามการไล่ระดับสีปกติ
ฟิลด์ มีเมล็ดการประเมินต่างๆ ให้เลือก พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ประเมิน = ดีเอส; dict
ประเภทย่อยของปลั๊กอิน ค่าที่รองรับคือ:
sq - สแควร์ของความแตกต่าง
ds - กำลังสองของผลต่างมาตราส่วน
จุด - เคอร์เนลผลิตภัณฑ์สเกลาร์
ข้าม - เคอร์เนลข้ามผลิตภัณฑ์

SSD ต้นทุนภาพ 2 มิติ: ผลรวมของผลต่างกำลังสอง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

อัตโนมัติ = 0; ลอยอยู่ใน [0, 1000]
ใช้การปิดบังภาพเคลื่อนไหวโดยอัตโนมัติโดยใช้ค่าความเข้มเท่านั้น
ให้มีขนาดใหญ่กว่าเกณฑ์ที่กำหนด

บรรทัดฐาน = 0; บูล
กำหนดว่าควรปรับเมตริกให้เป็นมาตรฐานด้วยจำนวนพิกเซลของรูปภาพหรือไม่

ssd-ออโต้มาสก์
ต้นทุนภาพ 2 มิติ: ผลรวมของส่วนต่างกำลังสอง พร้อมการมาร์กอัตโนมัติตามที่กำหนด
เกณฑ์ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

rthresh = 0; สองเท่า
ค่าความเข้มของเกณฑ์สำหรับรูปภาพอ้างอิง

นวด = 0; สองเท่า
ค่าความเข้มของเกณฑ์สำหรับรูปภาพต้นฉบับ

ปลั๊กอิน: 2dimage/เต็มราคา

ภาพ ฟังก์ชันต้นทุนความคล้ายคลึงกันของภาพทั่วไปที่รองรับความละเอียดหลายภาพ
กำลังประมวลผล. การวัดความคล้ายคลึงที่แท้จริงจะได้รับเป็นพารามิเตอร์พิเศษ
พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ราคา = เอสเอสดี; โรงงาน
เคอร์เนลฟังก์ชันต้นทุน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่ PLUGINS:2dimage/cost

การแก้ปัญหา = 0; บูล
บันทึก resuts ระดับกลางสำหรับการดีบัก

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ภาพฉลาก
ฟังก์ชันต้นทุนที่คล้ายคลึงกันซึ่งจับคู่ป้ายกำกับของรูปภาพสองภาพและจัดการป้ายกำกับ-
รักษาการประมวลผลหลายความละเอียด พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

การแก้ปัญหา = 0; int ใน [0, 1]
เขียนระยะทางแปลงเป็นภาพ 3 มิติ

ฉลากสูงสุด = 256; int ใน [2, 32000]
จำนวนฉลากสูงสุดที่ต้องพิจารณา

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ภาพสวมหน้ากาก
ฟังก์ชันต้นทุนความคล้ายคลึงกันของภาพที่ปิดบังโดยทั่วไปที่ยังจัดการหลาย-
การประมวลผลความละเอียด มาสก์ที่ให้มาควรเป็นบริเวณที่เติมอย่างแน่นหนาใน
การประมวลผลแบบหลายความละเอียดเพราะไม่เช่นนั้นข้อมูลมาสก์อาจสูญหาย
เมื่อลดขนาดภาพ มาสก์อ้างอิงและมาสก์ที่แปลงร่างของ
ภาพการศึกษาถูกรวมเข้าด้วยกันโดยไบนารีและ การวัดความคล้ายคลึงที่แท้จริงจะได้รับ
es พารามิเตอร์พิเศษ พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ราคา = เอสเอสดี; โรงงาน
เคอร์เนลฟังก์ชันต้นทุน สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:2dimage/maskedcost

อ้าง =(อินพุต, สตริง)
ภาพอ้างอิง

หน้ากากอ้างอิง =(อินพุต, สตริง)
มาสก์รูปภาพอ้างอิง (ไบนารี)

สิ่งอำนวยความสะดวก =(อินพุต, สตริง)
ภาพการศึกษา

Src-mask =(อินพุต, สตริง)
ศึกษาภาพมาสก์ (ไบนารี)

น้ำหนัก = 1; ลอย
น้ำหนักของฟังก์ชันต้นทุน

ปลั๊กอิน: ภาพ 2 มิติ/io

BMP รองรับอินพุต/เอาต์พุตภาพ BMP 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .BMP, .bmp

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ฐานข้อมูล Virtual IO เข้าและออกจากพูลข้อมูลภายใน

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .@

ไดคอม ภาพ 2 มิติ io สำหรับ DICOM

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .DCM, .dcm

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
เซ็นชื่อ 16 บิต ไม่ได้ลงนาม 16 บิต

EXR ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับอิมเมจ OpenEXR

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .EXR, .exr

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 32 บิต, จุดลอยตัว 32 บิต

jpg ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับ jpeg ภาพระดับสีเทา

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ไม่ได้ลงนาม 8 บิต

PNG ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับรูปภาพ png

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .PNG, .png

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ดิบ รองรับเอาต์พุตภาพ RAW 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .RAW, .raw

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

TIF รองรับอินพุต/เอาต์พุตภาพ TIFF 2D

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 16 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม

ทิวทัศน์ ปลั๊กอิน 2dimage io สำหรับรูปภาพ vista

นามสกุลไฟล์ที่รู้จัก: .V, .VISTA, .v, .vista

ประเภทองค์ประกอบที่รองรับ:
ข้อมูลไบนารี, เซ็นชื่อ 8 บิต, 8 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, เซ็นชื่อ 16 บิต, ไม่ได้ลงนาม 16 บิต,
เซ็นชื่อ 32 บิต, 32 บิตที่ไม่ได้ลงนาม, ทศนิยม 32 บิต, ทศนิยม 64
บิต

ปลั๊กอิน: 2dimage/หน้ากากราคา

lncc สหสัมพันธ์ข้ามทำให้เป็นมาตรฐานในเครื่องพร้อมรองรับการกำบัง, พารามิเตอร์ที่รองรับ
คือ:

w = 5; ใน [1, 256]
ครึ่งความกว้างของหน้าต่างที่ใช้สำหรับประเมินกากบาทที่แปลแล้ว
ความสัมพันธ์

mi ข้อมูลร่วมกันตาม Spline parzen พร้อมการปิดบัง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

ตัด = 0; ลอยอยู่ใน [0, 40]
เปอร์เซ็นต์ของพิกเซลที่จะตัดที่ความเข้มสูงและต่ำที่จะลบออก
ค่าผิดปกติ

ถังขยะ = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับภาพเคลื่อนไหว

เคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพเคลื่อนไหว parzen hinstogram สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

rbin = 64; ใน [1, 256]
จำนวนช่องฮิสโตแกรมที่ใช้สำหรับรูปภาพอ้างอิง

เคอร์เนล = [bspline:d=0]; โรงงาน
เคอร์เนล Spline สำหรับภาพอ้างอิง parzen hinstogram สำหรับปลั๊กที่รองรับ-
ดู PLUGINS:1d/splinekernel

NCC ความสัมพันธ์ข้ามมาตรฐานกับการสนับสนุนการกำบัง

(ไม่มีพารามิเตอร์)

SSD ผลรวมของผลต่างกำลังสองกับการมาส์ก

(ไม่มีพารามิเตอร์)

ปลั๊กอิน: 2dimage/แปลงร่าง

Affine การแปลงแบบ Affine (อิสระหกองศา) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

เข้มงวด การแปลงแบบแข็ง (เช่น การหมุนและการแปล สามองศาของ
เสรีภาพ) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ศูนย์เน่า = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
จุดศูนย์กลางการหมุนสัมพัทธ์ คือ <0.5,0.5> ตรงกับจุดศูนย์กลางของ
รองรับสี่เหลี่ยมผืนผ้า

การหมุน การแปลงการหมุน (เช่น การหมุนรอบจุดศูนย์กลางที่กำหนด หนึ่งองศาของ
เสรีภาพ) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ศูนย์เน่า = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
จุดศูนย์กลางการหมุนสัมพัทธ์ คือ <0.5,0.5> ตรงกับจุดศูนย์กลางของ
รองรับสี่เหลี่ยมผืนผ้า

เส้นโค้ง การแปลงรูปแบบอิสระที่สามารถอธิบายได้ด้วยชุดสัมประสิทธิ์ B-spline
และเคอร์เนล B-spline พื้นฐาน พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

แอนิโซเรท = [[0,0]]; 2dfเวกเตอร์
อัตราสัมประสิทธิ์แอนไอโซทรอปิกเป็นพิกเซล ค่าที่ไม่เป็นบวกจะเป็น
เขียนทับโดยค่า 'อัตรา'..

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

เมล็ด = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลการแปลง spline.. สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

การลงโทษ = ; โรงงาน
ระยะโทษของการเปลี่ยนแปลง สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:2dtransform/splinepenalty

อัตรา = 10; ลอยใน [1, inf)
อัตราสัมประสิทธิ์ไอโซโทรปิก หน่วยเป็นพิกเซล

แปลความ การแปลเท่านั้น (อิสระสององศา) พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

vf ปลั๊กอินนี้ใช้การแปลงที่กำหนดการแปลสำหรับแต่ละ
จุดกริดที่กำหนดโดเมนของการเปลี่ยนแปลง, รองรับ
พารามิเตอร์คือ:

เป็น imgboundary = กระจกเงา; โรงงาน
เงื่อนไขขอบเขตการแก้ไขภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinebc

imgเคอร์เนล = [bspline:d=3]; โรงงาน
เคอร์เนลตัวแก้ไขรูปภาพ สำหรับปลั๊กอินที่รองรับ โปรดดูที่
ปลั๊กอิน:1d/splinekernel

ปลั๊กอิน: 2dtransform/slinepenalty

ดิวิเคิร์ล บทลงโทษ divcurl ในการแปลง พารามิเตอร์ที่รองรับคือ:

โค้ง = 1; ลอยใน [0, inf)
น้ำหนักโทษเมื่อขด

div = 1; ลอยใน [0, inf)
น้ำหนักโทษบนไดเวอร์เจนซ์

บรรทัดฐาน = 0; บูล
ตั้งค่าเป็น 1 หากการปรับโทษควรจะเป็นมาตรฐานที่เกี่ยวกับภาพ
ขนาด.

น้ำหนัก = 1; ลอยเข้ามา (0, inf)
น้ำหนักของพลังงานโทษ

ตัวอย่าง

ลงทะเบียนชุด perfusion ที่ระบุใน segment.set โดยการเพิ่มประสิทธิภาพ spline based
การแปลงด้วยอัตราสัมประสิทธิ์ 16 พิกเซลโดยใช้ข้อมูลร่วมกันและการลงโทษ
การแปลงโดยใช้ divcurl ที่มีน้ำหนัก 2.0

mia-2dmyoset-all2one-nonrigid -i segment.set -o register.set
-f spline:rate=16,penalty=[divcurl:weight=2.0] ภาพ:ราคา=mi,น้ำหนัก=2.0

ผู้เขียน

เกิร์ท วอลนี่

ลิขสิทธิ์

ซอฟต์แวร์นี้เป็นลิขสิทธิ์ (c) 1999-2015 ไลป์ซิก เยอรมนี และมาดริด สเปน มันมา
โดยไม่มีการรับประกันใดๆ และคุณสามารถแจกจ่ายซ้ำได้ภายใต้เงื่อนไขของ GNU
ใบอนุญาตสาธารณะทั่วไป เวอร์ชัน 3 (หรือใหม่กว่า) สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม ให้รันโปรแกรมด้วยปุ่ม
ตัวเลือก '--ลิขสิทธิ์'

ใช้ mia-2dmyoset-all2one-nonrigid ออนไลน์โดยใช้บริการ onworks.net