นี่คือแอพลินุกซ์ชื่อ Grinder ซึ่งสามารถดาวน์โหลดรีลีสล่าสุดเป็น Grinder-0.5.4.tar.gz สามารถเรียกใช้ออนไลน์ใน OnWorks ผู้ให้บริการโฮสต์ฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Grinder พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
โม่
Ad
DESCRIPTION
Grinder เป็นเครื่องมือไบโออินฟอร์มาติกแบบโอเพนซอร์ซอเนกประสงค์เพื่อสร้างคลังปืนลูกซอง omic และลำดับแอมพลิคอนจำลองสำหรับแพลตฟอร์มการจัดลำดับหลักทั้งหมด
คุณสมบัติ
- ปืนลูกซองหรือแอมพลิคอน (เช่น 16S rRNA) อ่านไลบรารี
- omics รองรับการสร้างชุดข้อมูล genomic, transcriptomic, proteomic, metagenomic, metatranscriptomic หรือ metaproteomic
- การกระจายความยาวอ่านโดยพลการและจำนวนการอ่าน
- การจำลอง PCR และข้อผิดพลาดในการจัดลำดับ (chimeras, point mutation, homopolymers)
- รองรับชุดข้อมูลปลายคู่ (คู่คู่)
- การตั้งค่าระดับความอุดมสมบูรณ์เฉพาะหรือให้ความอุดมสมบูรณ์ด้วยตนเองสำหรับแต่ละจีโนม ยีนหรือโปรตีน
- การสร้างชุดข้อมูลที่มีความสมบูรณ์ที่กำหนด (ความหลากหลายของอัลฟา)
- ชุดข้อมูลที่เกี่ยวข้องสามารถแบ่งปันจำนวนตัวแปรของจีโนมได้ (ความหลากหลายของเบต้า)
- การสร้างแบบจำลองของอคติที่สร้างขึ้นโดยความยาวที่แตกต่างกันของจีโนมหรือหมายเลขสำเนายีน
- กลไกโปรไฟล์เพื่อจัดเก็บตัวเลือกที่ต้องการ
- มีให้สำหรับนักชีววิทยาหรือผู้ใช้ระดับสูงผ่านอินเทอร์เฟซที่หลากหลาย: GUI, CLI และ API
ผู้ชม
วิทยาศาสตร์/การวิจัย
ส่วนติดต่อผู้ใช้
คอนโซล/เทอร์มินัล
ภาษาโปรแกรม
Perl
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/biogrinder/ มีการโฮสต์ใน OnWorks เพื่อให้ทำงานออนไลน์ในวิธีที่ง่ายที่สุดจากหนึ่งในระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
