นี่คือแอป Linux ชื่อ Seurat ซึ่งสามารถดาวน์โหลดเวอร์ชันล่าสุดได้ที่ Version5.3.0sourcecode.tar.gz สามารถใช้งานออนไลน์ได้บน OnWorks ซึ่งเป็นผู้ให้บริการโฮสติ้งฟรีสำหรับเวิร์กสเตชัน
ดาวน์โหลดและเรียกใช้แอปนี้ออนไลน์ชื่อ Seurat พร้อม OnWorks ฟรี
ทำตามคำแนะนำเหล่านี้เพื่อเรียกใช้แอปนี้:
- 1. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่นนี้ในพีซีของคุณ
- 2. เข้าไปที่ file manager https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX ด้วยชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 3. อัปโหลดแอปพลิเคชันนี้ในตัวจัดการไฟล์ดังกล่าว
- 4. เริ่มโปรแกรมจำลองออนไลน์ของ OnWorks Linux หรือ Windows ออนไลน์ หรือโปรแกรมจำลองออนไลน์ MACOS จากเว็บไซต์นี้
- 5. จาก OnWorks Linux OS คุณเพิ่งเริ่มต้น ไปที่ตัวจัดการไฟล์ของเรา https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX พร้อมชื่อผู้ใช้ที่คุณต้องการ
- 6. ดาวน์โหลดแอปพลิเคชั่น ติดตั้ง และเรียกใช้
ภาพหน้าจอ
Ad
สูรัต
DESCRIPTION
Seurat คือชุดเครื่องมือ R ที่ครอบคลุมสำหรับการวิเคราะห์จีโนมิกส์เซลล์เดี่ยว เปิดตัวโดย Satija Lab ที่ NYGC ชุดเครื่องมือนี้รองรับการควบคุมคุณภาพ การทำให้เป็นมาตรฐาน การจัดกลุ่ม การผสานรวมข้อมูลหลายโหมด (เช่น scRNA‑seq, spatial, CITE‑seq) และการสร้างภาพ Seurat v5 นำเสนอเวิร์กโฟลว์ที่ปรับขนาดได้และการสนับสนุนทรานสคริปโตมิกส์เชิงพื้นที่ ซึ่งมักใช้ในงานวิจัยทางวิชาการและอุตสาหกรรมสำหรับการศึกษาเซลล์เดี่ยว
คุณสมบัติ
- ท่อควบคุมคุณภาพและการทำให้เป็นมาตรฐานสำหรับ scRNA-seq
- การลดมิติ การจัดกลุ่ม และคำอธิบายประเภทเซลล์
- การบูรณาการระหว่างตัวอย่างและโหมดต่างๆ
- การวิเคราะห์และการแสดงภาพทรานสคริปโตมิกส์เชิงพื้นที่
- จัดการชุดข้อมูลขนาดใหญ่ได้อย่างมีประสิทธิภาพ (ความสามารถในการปรับขนาด v5)
- เรื่องราวสั้นๆ บทช่วยสอน และการบูรณาการกับ Bioconductor ที่ครอบคลุม
ภาษาโปรแกรม
R
หมวดหมู่
นี่คือแอปพลิเคชันที่สามารถดึงข้อมูลจาก https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/ ได้ แอปพลิเคชันนี้โฮสต์อยู่ใน OnWorks เพื่อให้ใช้งานออนไลน์ได้ง่ายที่สุดจากระบบปฏิบัติการฟรีของเรา
