bp_search2tribep - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

bp_search2tribe - Gawing TRIBE matrix ang SearchIO parseable na mga ulat

SINOPSIS

Paggamit ng:
bp_search2tribe [-o outputfile] [-f reportformat] [-w/--weight] file1 file2 ..

DESCRIPTION

Ang script na ito ay malamang na masyadong mabagal para sa karamihan ng mga gumagamit. Ito ay mas mahusay na gumamit ng isang bagay
tulad ng mga script/searchio/fastam9_to_table, -m 9 na output mula sa BLAST, o ang blast2table mula sa
ang BLAST O'Reilly na aklat upang makakuha ng isang tabular na output mula sa mga programang ito at pagkatapos ay pakainin ang
talahanayan sa MCL na may mcxdeblast script at ang --m9 na opsyon.

Gagawin ng script na ito ang isang ulat sa paghahanap ng protina (BLASTP, FASTP, SSEARCH) sa isang Markov
Matrix para sa TribeMCL clustering.

Ang mga pagpipilian ay:

-o filename - ang output filename [default STDOUT]
-f format - format ng resulta ng paghahanap (sabog, fasta)
(fasta format ang ssearch). ang default ay sabog.
-w o --weight VALUE - Baguhin ang default na timbang para sa E(0.0) na mga hit
sa VALUE (default=200 (ibig sabihin 1e-200) )
-h - menu ng tulong na ito

Bilang karagdagan, tukuyin ang mga filename na gusto mong iproseso sa command-line. Kung walang files
ay tinukoy pagkatapos STDIN input ay ipinapalagay. Tinukoy mo ito sa pamamagitan ng paggawa ng: bp_search2tribe
file1 file2 file3

Gamitin ang bp_search2tribep online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net