Ito ang command na gt-matchtool na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
gt-matchtool - I-parse ang mga format ng tugma at/o gumamit ng mga tool sa pagtutugma.
SINOPSIS
gt kasangkapan ng posporo [pagpipilian ...]
DESCRIPTION
-Uri [...]
pumili ng tugmang format ng file: OPENMATCH: buksan tumugma format, hal vmatch BLASTOUT : tabular
BLAST output (-m 8) BLASTALLP: invoke BLASTALL with blastp BLASTALLN: invoke BLASTALL
may blastn BLASTP : invoke blastp BLASTN : invoke blastn LAST : invoke LAST SW : gamitin
Smith-Waterman (default: OPENMATCH)
-matchfile [filename]
itakda ang pangalan ng file ng input (default: hindi natukoy)
-db [filename]
itakda ang pangalan ng file ng database (default: hindi natukoy)
-swminlen [halaga]
itakda ang minimum na kinakailangang haba ng alignment (para sa Smith-Waterman alignment) (default: 10)
-swmaxedist [halaga]
itakda ang maximum na pinapayagang distansya sa pag-edit (para sa Smith-Waterman alignment) (default: 0)
-tanong [filename]
itakda ang pangalan ng file ng query (default: hindi natukoy)
-tulong
ipakita ang tulong at paglabas
-version
ipakita ang impormasyon ng bersyon at lumabas
Pag-uulat TUMBOK
Mag-ulat ng mga bug sa[protektado ng email]>.
Gumamit ng gt-matchtool online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net