Ito ang command na kmc_tools na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
kmc_tools - mga karagdagang operasyon sa k-mer database
SINOPSIS
kmc_tools [mga pandaigdigang parameter] [mga parameter ng operasyon]
DESCRIPTION
Ang utos na ito at ang iba't ibang subcomment nito ay nagpapatupad ng ilang operasyon sa KMC
mga database.
k-mers set pagpapatakbo para 2 KMC Mga Database
bumalandra
intersection ng 2 k-mers set
kmers_subtract
pagbabawas ng 2 k-mers set
counters_subtract
mga counter na pagbabawas ng 2 k-mer set
unyon
unyon ng 2 k-mers set
pagpapatakbo para solong kmc database
uri
nag-uuri ng mga k-mer mula sa database na nabuo ng KMC2.x
bawasan
ibukod ang masyadong bihira at masyadong madalas na k-mer
siksik
alisin ang mga counter (mag-imbak lamang ng mga k-mers)
histogram
histogram ng k-mers na mga pangyayari
tambakan ng basura
dump k-mers at mga counter sa text file
mas marami pang mahirap unawain operasyon:
mahirap unawain
kumplikadong mga operasyon na may isang bilang ng mga database ng input
iba operasyon:
filter
i-filter ang mga nabasa na may masyadong maliit na bilang ng mga k-mer
Opsyon
global mga parameter:
-t
kabuuang bilang ng mga thread (default: no. ng mga CPU core)
-v
paganahin ang verbose mode (nagpapakita ng ilang impormasyon) (default: false)
-hp
itago ang porsyento ng pag-unlad (default: false)
Halimbawa
kmc_tools union db1 -ci3 db2 -ci5 -cx300 db1_union_db2 -ci10
Gumamit ng kmc_tools online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net
