Ito ang command mapMers-depth na maaaring patakbuhin sa OnWorks na libreng hosting provider gamit ang isa sa aming maramihang libreng online na workstation gaya ng Ubuntu Online, Fedora Online, Windows online emulator o MAC OS online emulator
PROGRAMA:
NAME
mapMers-depth - mag-ulat ng impormasyon tungkol sa pagmamapa ng mga kmer sa mga sequence
SINOPSIS
mapaMers-depth {-bilang|-lalim|-stats} -mers MERYL -m MERSIZE -seq SA.FASTA
Opsyon
Mga Mode of operasyon
Para sa sequence ordinal 's' at posisyon sa sequence na 'p':
-bilang nag-uulat ng bilang (c) ng solong kmer na nagsisimula sa posisyon (p).
Format: 'spc'
-lalim iniuulat ang bilang (n) ng mga kmer na sumasaklaw sa posisyon (p).
Format: 'spn'
-stats nag-uulat ng minimum (m), maximum (M), at average (a) na bilang ng lahat ng mer na sumasaklaw
posisyon (p). nag-uulat din ng kabuuang bilang (t) at bilang ng mga kmer (n)
Format: 'spm M atn'
Pangkalahatan
-m MERSIZE
-mers MERYL
meryl(1) database
-seq SA.FASTA
fasta input sequence
Gamitin ang mapMers-depth online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net