Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen komuttur.
Program:
ADI
dan - Nükleik asit erime sıcaklığını hesaplar
SİNOPSİS
oyleyse -sıra devamı -Pencere boyutu tamsayı -vardiya artışı tamsayı -dnaconc şamandıra
-tuzlu kons şamandıra [-ürün geçiş] -formamid şamandıra -uyumsuzluk şamandıra -prodlen tamsayı
[-termo geçiş] -sıcaklık şamandıra -rna boole -komplo geçiş -mintemp şamandıra
-graf ksigraf -outfile rapor
oyleyse -Yardım
TANIM
oyleyse EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık Yazılımı) bir komut satırı programıdır.
Süit”). "Nükleik:Özellikler,Nükleik:Kompozisyon" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra devamı
gereklidir Bölüm
-Pencere boyutu tamsayı
Dizinin erime noktası ve diğer termodinamik özellikleri değerleri
pencere olarak bilinen kısa bir dizi uzunluğu alarak ve
bu penceredeki dizinin özellikleri. Pencere kademeli olarak hareket ettirilir.
özelliklerin her yeni konumda hesaplandığı sıra. Varsayılan değer: 20
-vardiya artışı tamsayı
Bu, pencereyi bulmak için her artışta hareket ettirilen miktardır.
dizi boyunca erime noktası ve diğer özellikler. Varsayılan değer: 1
-dnaconc şamandıra
Varsayılan değer: 50.
-tuzlu kons şamandıra
Varsayılan değer: 50.
Ek Bölüm
PLATFORM seçenekleri
-ürün geçiş
Bu, formamid yüzdesini, izin verilen uyumsuzluk yüzdesini ve ürün uzunluğunu ister.
-formamid şamandıra
Bu, hesaplamalarda kullanılacak formamid yüzdesini belirtir (olmadıkça göz ardı edilir).
-ürün kullanılmıştır). Varsayılan değer: 0.
-uyumsuzluk şamandıra
Bu, hesaplamalarda kullanılacak uyumsuzluk yüzdesini belirtir (olmadığı sürece yoksayılır.
-ürün kullanılmıştır). Varsayılan değer: 0.
-prodlen tamsayı
Bu, hesaplamalarda kullanılacak ürün uzunluğunu belirtir (olmadıkça göz ardı edilir).
-ürün kullanılmıştır). Varsayılan değer: $(pencere boyutu)
Termodinamik seçenekleri
-termo geçiş
Sekans pencerelerinin DeltaG, DeltaH ve DeltaS değerlerini çıkış verilerine aktarın
dosyası.
-sıcaklık şamandıra
-thermo belirtilmişse, bu, hangi sıcaklığın kullanılacağını belirtir.
DeltaG, DeltaH ve DeltaS değerlerini hesaplayın. Varsayılan değer: 25.
gelişmiş Bölüm
-rna boole
Bu, dizinin bir DNA dizisi değil, bir RNA dizisi olduğunu belirtir.
Çıktı Bölüm
-komplo geçiş
Bu belirtilmezse, çıktı verilerinin dosyası üretilir, aksi takdirde
dizi boyunca erime noktası üretilir.
-mintemp şamandıra
Çizimin sıcaklık ölçeği (y ekseni) için minimum bir değer girin. Varsayılan değer:
55
-graf ksigraf
-outfile rapor
Bir grafik üretilmiyorsa, her pencerede erime noktası vb. ile ilgili veriler
dizi boyunca dosyaya çıktı verilir.
onworks.net hizmetlerini kullanarak dane'yi çevrimiçi kullanın
