Bu, en son sürümü quast-5.0.2.tar.gz olarak indirilebilen QUAST adlı Linux uygulamasıdır. İş istasyonları için ücretsiz barındırma sağlayıcısı OnWorks'te çevrimiçi olarak çalıştırılabilir.
QUAST adlı bu uygulamayı OnWorks ile ücretsiz olarak indirin ve çevrimiçi çalıştırın.
Bu uygulamayı çalıştırmak için şu talimatları izleyin:
- 1. Bu uygulamayı PC'nize indirdiniz.
- 2. Dosya yöneticimize https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX istediğiniz kullanıcı adını girin.
- 3. Bu uygulamayı böyle bir dosya yöneticisine yükleyin.
- 4. Bu web sitesinden OnWorks Linux çevrimiçi veya Windows çevrimiçi öykünücüsünü veya MACOS çevrimiçi öykünücüsünü başlatın.
- 5. Yeni başladığınız OnWorks Linux işletim sisteminden, istediğiniz kullanıcı adıyla https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX dosya yöneticimize gidin.
- 6. Uygulamayı indirin, kurun ve çalıştırın.
EKRAN
Ad
QUAST
AÇIKLAMA
QUAST, genom düzeneklerinin hızlı ve uygun kalite değerlendirmesini ve karşılaştırmasını gerçekleştirir.
QUAST, contig doğruluğu, keşfedilen gen sayısı, N50 ve diğerleri dahil olmak üzere bir dizi iyi bilinen ölçümü hesaplar ve ayrıca NA50 gibi yenilerini sunar (ayrıntılar için makale ve kılavuza bakın). Kapsamlı bir analiz, özet tablolarda (düz metin, sekmeyle ayrılmış ve LaTeX formatlarında) ve renkli grafiklerde sonuçlanır. Araç aynı zamanda tüm bilgileri gezinmesi kolay tek bir dosyada toplayan web tabanlı raporlar da üretir.
QUAST, sezgisel bir komut satırı arayüzüne ve kullanıcıların onu çalıştırmasına ve çıktısını anlamasına yardımcı olacak ayrıntılı bir kılavuza sahiptir. Ayrıca, Laboratuar web-QUAST'ın Beta sürümünü şu adreste başlattı: http://quast.bioinf.spbau.ru/ bu da kalite değerlendirmesini daha da basitleştirir.
QUAST ve MetaQUAST (metagenomic düzenekler için uzantı) makaleleri Bioinformatics'te yayınlandı.
Özellikler
- web tabanlı raporlar, düz txt, sekmeyle ayrılmış ve LaTeX formatlarında tablolar
- renkli grafikler ve histogramlar
- referans genomu olan ve olmayan kalite değerlendirmesi
- metagenomik düzeneklerin kalite değerlendirmesi
- etkileşimli contig tarayıcısı
Seyirci
Bilim/Araştırma, Geliştiriciler, Son Kullanıcılar/Masaüstü
Kullanıcı arabirimi
Web tabanlı, Komut satırı
Programlama dili
Python, Javascript
Kategoriler
Bu, https://sourceforge.net/projects/quast/ adresinden de getirilebilecek bir uygulamadır. Ücretsiz İşletim Sistemlerimizden birinden en kolay şekilde çevrimiçi çalıştırılabilmesi için OnWorks'te barındırılmıştır.
