Це команда cmtk-volume_reconstruction, яку можна запустити у безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
volume_reconstruction - реконструкція обсягу
СИНТАКСИС
volume_reconstruction [параметри] refImage xform0 inImage0 [xform1 inImage1 ...]
ОПИС
Ітеративна реконструкція об’єму з спільно зареєстрованих зображень з використанням зворотної інтерполяції або
розмитість суглобів
ВАРІАНТИ
Глобальний Інструментарій Опції (ці він має загальні by всі CMTK інструменти)
--допомога
Запишіть список основних параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--допомога-всім
Запишіть повний список основних і розширених параметрів командного рядка до стандартного виводу.
--вікі
Запишіть список параметрів командного рядка до стандартного виводу в розмітці MediaWiki.
-- чоловік
Запишіть джерело сторінки керівництва в розмітці 'nroff' до стандартного виводу.
-- версія
Записати версію набору інструментів у стандартний вихід.
--луна
Запишіть поточний командний рядок у стандартний вихід.
--розширений рівень
Встановити рівень детальності.
-багатослівний, -v
Збільшити рівень детальності на 1 (не рекомендовано; підтримується для зворотної сумісності).
--нитки
Встановити максимальну кількість паралельних потоків (для потоків POSIX і OpenMP).
вхід Опції
--exclude-first-image, -x
Виключити перше зображення з реконструкції як окреме цільове зображення реєстрації)
--урожай
Обрізати посилання на область пікселів x0,y0,z1:x1,y1,z1
--прохідна вага , -W
Установіть вагу внеску для проходу у формі 'pass:weight'
Реконструкція сітка
--recon-сітка
Визначити сітку реконструкції як Nx,Ny,Nz:dX,dY,dZ[:Ox,Oy,Oz] (dims:pixel:offset)
--recon-grid-path , -R
Укажіть шлях до сітки, яка визначає сітку реконструйованого зображення [включаючи зміщення] [За замовчуванням:
НЕМАЄ]
Початковий Об'єм Вприск Параметри
--ізотропні ін'єкції
Використовуйте ізотропну ін’єкцію об’єму [інакше: масштабується за допомогою розміру пікселя зображення на прохід
вимір]
--injection-kernel-sigma , -S
Стандартне відхилення ядра Гаусса для ін’єкції об’єму, кратне розміру пікселя
в кожному напрямку. [За замовчуванням: 1]
--injection-kernel-radius , -r
Коефіцієнт радіуса скорочення ядра ін'єкції. Ядро обрізається на
sigma*radius, де sigma – стандартне відхилення ядра. [За замовчуванням: 2]
Об'єм Реконструкція Опції
--inverse-interpolation-kernel
Ядро для відновлення інверсної інтерполяції Підтримувані значення: "cubic",
"linear", "hamming-sinc", "cosine-sinc", де за замовчуванням є "cubic", або використовуйте один із
наступні:
--кубічний, -C
Трикубічна інтерполяція [Це is за замовчуванням]
--лінійний, -L
Трилінійна інтерполяція (швидша, але менш точна)
--hamming-sinc, -H
Синк-інтерполяція з вікном Хеммінга
--косинус-синк, -O
Інтерполяція sinc з косинусним вікном (найточніша, але найповільніша)
--розмивання
Форма ядра для апроксимації функції розповсюдження точки для зменшення розмитості
реконструкція (вибір одного з них вимикає реконструкцію зворотної інтерполяції)
Підтримувані значення: "box", "gaussian" або використовуйте одне з наступного:
--коробка
Ядро коробчатої форми
--гаусів
Гауссове ядро
--psf
Явно встановіть розмір функції поширення точок як x,y,z. Використовуйте з ядром «deblurring».
реконструкція.
--psf-шкала
Розмір функції розповсюдження точок масштабу за цим значенням. Використовуйте з ядром «deblurring».
реконструкція. [За замовчуванням: 1]
Оптимізація Параметри
--кількість ітерацій , -n
Максимальна кількість ітерацій зворотної інтерполяції [За замовчуванням: 20]
--помилка четвертого порядку, -f
Використовуйте помилку четвертого (а не другого порядку) для оптимізації.
Регуляризація Параметри
--l-норма-вага
Встановити вагу обмеження для регуляризації L-норми типу Тихонова (0 вимикає обмеження)
[За замовчуванням: 0]
--без усічення, -T
Вимкніть нелінійне регіональне скорочення інтенсивності
Вихід Опції
- вихід , -o
Вихідний шлях для остаточного реконструйованого зображення [За замовчуванням: реконструйований.ніі ]
--write-injected-image
Запишіть початкове зображення, введене томом, у цей шлях [За замовчуванням: НЕМАЄ]
--write-lowest-max-error-image
Додатковий шлях для запису реконструйованого зображення з найменшою МАКСИМАЛЬНОЮ помилкою. [За замовчуванням:
НЕМАЄ]
--write-images-as-float, -F
Запис вихідних зображень у вигляді плаваючої коми
AUTHORS
Торстен Ролфінг за участю Майкла П. Хасака, Грега Джеффріса, Келвіна Р.
Маурер, Даніель Б. Руссаков, Ярослав Гальченко
Використовуйте cmtk-volume_reconstruction онлайн за допомогою сервісів onworks.net
