Це команда extractseqe, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших численних безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
extractseq - Витягувати області з послідовності
СИНТАКСИС
екстракти - послідовність послідовність -регіонів діапазон [-окремі boolean] -outseq seqoutall
екстракти -допомога
ОПИС
екстракти — це програма командного рядка від EMBOSS («Європейська молекулярна біологія Open
Пакет програмного забезпечення»). Це частина команд (груп) «Редагувати».
ВАРІАНТИ
вхід розділ
- послідовність послідовність
Вимагається розділ
-регіонів діапазон
Регіони для вилучення. Набір регіонів визначається набором пар позицій. The
позиції цілі числа. Вони розділені будь-яким нецифровим, не альфа-символом.
Приклади специфікацій регіону: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99 Значення за замовчуванням: $(sequence.begin)-$(sequence.end)
Додатковий розділ
-окремі boolean
Якщо для цього параметра встановлено значення true, кожна зазначена область записується як окрема послідовність.
Назва послідовності створюється з назви вихідної послідовності з
початкова та кінцева позиції діапазону, додані символами підкреслення між ними,
наприклад: область XYZ від 2 до 34 записується як: XYZ_2_34 Значення за замовчуванням: N
Вихід розділ
-outseq seqoutall
Використовуйте extraseqe онлайн за допомогою служб onworks.net
