Це команда kmc_tools-complex, яку можна запустити в безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних онлайн-робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
kmc_tools-complex - складні операції з низкою вхідних баз даних
СИНТАКСИС
Комплекс kmc_tools
ОПИС
Ця команда виконує комбінацію операцій, як визначено
. Це текстовий файл із таким синтаксисом:
__________________________________________________________________
|ВХІД: |
| = [параметри] |
| = [параметри] |
|... |
| = [параметри] |
|ВИХІД: |
| = [ [...] |
|[ВИВІДНІ_ПАРАМЕРИ: __|
| ] | /
| | /
|________________________________________________________________|/
ПАРАМЕТРИ
вхід1, вхід2, ..., вхідN
назви вхідних даних, що використовуються для визначення рівняння
input1_db_path, input2_db_path, ..., inputN_db_path
шляхи до множин k-mers
Для кожного входу є додаткові параметри, які можна встановити:
-ci
виключити k-мерів, що зустрічаються менше ніж разів
cx
виключити k-mers, що зустрічаються більше ніж разів
out_db_path
шлях до вихідної бази даних
ref_input
один із input1, input2, ..., inputN
опер
один із {*,-,~,+}, який посилається на {intersect, kmers_subtract, counters_subtract,
союз}
Оператор '*' має найвищий пріоритет. Інші оператори мають однакові пріоритети. Порядок
операції можна змінювати за допомогою дужок.
Вихідні параметри:
-ci
виключити k-мерів, що зустрічаються менше ніж разів
-cx
виключити k-mers, що зустрічаються більше ніж разів
-cs
максимальне значення лічильника
приклад
__________________________________________________________________
|ВХІД: |
|set1 = kmc_o1 -ci5 |
|set2 = kmc_o2 |
|set3 = kmc_o3 -ci10 -cx100 __|
|ВИХІД: | /
|результат = (набір3+набір1)*набір2 | /
|________________________________________________________________|/
Використовуйте kmc_tools-complex онлайн за допомогою сервісів onworks.net
