Це команда mapMers-depth, яку можна запустити в постачальнику безкоштовного хостингу OnWorks за допомогою однієї з наших безкоштовних робочих станцій, таких як Ubuntu Online, Fedora Online, онлайн-емулятор Windows або онлайн-емулятор MAC OS
ПРОГРАМА:
ІМ'Я
mapMers-depth - повідомляє інформацію про відображення kmers у послідовності
СИНТАКСИС
mapMers-глибина {-рахувати|- глибина|- статистика} -мерс МЕРИЛ -m MERSIZE -посл ІН.ФАСТА
ВАРІАНТИ
Режими of операція
Для порядкового 's' та позиції в цій послідовності 'p':
-рахувати повідомляє кількість (с) одного кмера, який починається в позиції (p).
Формат: 'spc'
- глибина повідомляє кількість (n) кілометрів, які охоплюють позицію (p).
Формат: 'spn'
- статистика повідомляє про мінімальну (m), максимальну (M) і середню (a) кількість усіх mer, які охоплюють
положення (p). також повідомляє загальну кількість (t) і кількість кілометрів (n)
Формат: 'spm M atn'
Загальне
-m MERSIZE
-мерс МЕРИЛ
Меріл(1) база даних
-посл ІН.ФАСТА
Послідовність введення fasta
Використовуйте mapMers-depth онлайн за допомогою служб onworks.net