Це програма для Linux під назвою Seurat, останню версію якої можна завантажити як Version5.3.0sourcecode.tar.gz. Її можна запускати онлайн на безкоштовному хостинг-провайдері OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою Seurat з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть онлайн-емулятор OnWorks Linux або Windows або онлайн-емулятор MACOS з цього веб-сайту.
- 5. З ОС OnWorks Linux, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму, встановіть її та запустіть.
ЕКРАНИ
Ad
Сера
ОПИС
Seurat — це комплексний інструментарій на R для аналізу геноміки окремих клітин, представлений лабораторією Satija в Нью-Йоркському гірничому інституті. Він підтримує контроль якості, нормалізацію, кластеризацію, інтеграцію мультимодальних даних (наприклад, scRNA-секвенування, просторове, CITE-секвенування) та візуалізацію. Seurat v5 пропонує масштабовані робочі процеси та підтримку просторової транскриптоміки, що зазвичай використовується в академічних та галузевих дослідженнях для досліджень окремих клітин.
Функції
- Конвеєри контролю якості та нормалізації для scRNA-seq
- Зменшення розмірів, кластеризація та анотація типів клітин
- Інтеграція між зразками та модалітами
- Просторовий транскриптомічний аналіз та візуалізація
- Ефективно обробляє великомасштабні набори даних (масштабованість v5)
- Розширені віньєтки, навчальні посібники та інтеграція з Bioconductor
Мова програмування
R
Категорії
Цю програму також можна завантажити з https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/. Вона розміщена на OnWorks для найпростішого запуску онлайн з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
