Це програма для Windows під назвою misc genomics tools, останню версію якої можна завантажити як misc_genomics_tools_v0.2.zip. Його можна запустити в режимі онлайн за допомогою безкоштовного хостинг-провайдера OnWorks для робочих станцій.
Завантажте та запустіть онлайн цю програму під назвою misc genomics tools з OnWorks безкоштовно.
Дотримуйтесь цих інструкцій, щоб запустити цю програму:
- 1. Завантажив цю програму на свій ПК.
- 2. Введіть у наш файловий менеджер https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX із потрібним ім'ям користувача.
- 3. Завантажте цю програму в такий файловий менеджер.
- 4. Запустіть будь-який онлайн емулятор ОС OnWorks з цього веб-сайту, але кращий онлайн-емулятор Windows.
- 5. З ОС OnWorks Windows, яку ви щойно запустили, перейдіть до нашого файлового менеджера https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX з потрібним іменем користувача.
- 6. Завантажте програму та встановіть її.
- 7. Завантажте Wine зі сховищ програмного забезпечення дистрибутивів Linux. Після встановлення ви можете двічі клацнути програму, щоб запустити їх за допомогою Wine. Ви також можете спробувати PlayOnLinux, модний інтерфейс замість Wine, який допоможе вам встановити популярні програми та ігри Windows.
Wine — це спосіб запуску програмного забезпечення Windows на Linux, але без використання Windows. Wine — це рівень сумісності Windows з відкритим вихідним кодом, який може запускати програми Windows безпосередньо на будь-якому робочому столі Linux. По суті, Wine намагається повторно реалізувати достатньо Windows з нуля, щоб він міг запускати всі ці програми Windows, насправді не потребуючи Windows.
ЕКРАНИ
Ad
різні інструменти геномики
ОПИС
Це набір різноманітних програм, розроблених в ході проекту з геноміки, за участю штаму Pseudomonas NCIMB10586.
До них відносяться
* виявлення та виправлення помилок у (наприклад) послідовності геному pacbio за допомогою зчитування illumina
* анотація послідовності/геному прокаріотів
* Аналіз RNAseq - нормалізація та зіставлення кількох зразків як групи
* Візуалізація RNAseq
Усі сценарії надаються за принципом «найкращих зусиль», однак через різні системні зміни я не гарантую, що всі файли є версією, використаною в аналізі.
Також майте на увазі, що вони були дуже розроблені з урахуванням доцільності - тобто очікувалося, що процес буде виконано в остаточному вигляді один раз; мало уваги приділялося оптимізації часу виконання або об’єднанню сценаріїв разом, і іноді зовнішні ресурси доступні вручну.
риси
- Виправлення помилок послідовності геному
- Анотація прокаріотичної послідовності
- Нормалізація RNAseq кількох зразків як групи
- Серія зразків RNAseq/візуалізація в часі
Аудиторія
Наука/Дослідження
Мова програмування
Perl
Категорії
Це додаток, який також можна отримати з https://sourceforge.net/projects/misc-genomics-tools/. Його розміщено в OnWorks, щоб його можна було запустити в Інтернеті найпростішим способом з однієї з наших безкоштовних операційних систем.
