Đây là lệnh gt-matchtool có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
gt-matchtool - Phân tích cú pháp các định dạng so khớp và/hoặc gọi các công cụ so khớp.
SYNOPSIS
gt que diêm [Lựa chọn ...]
MÔ TẢ
-kiểu [hữu ích. Cảm ơn !]
chọn định dạng tệp khớp: OPENMATCH: mở phù hợp với định dạng, ví dụ vmatch BLASTOUT : dạng bảng
Đầu ra BLAST (-m 8) BLASTALLP: gọi BLASTALL bằng blastp BLASTALLN: gọi BLASTALL
với blastn BLASTP : gọi blastp BLASTN : gọi blastn LAST : gọi LAST SW : sử dụng
Smith-Waterman (mặc định: OPENMATCH)
-matchfile [tên tập tin]
đặt tên tệp đầu vào (mặc định: không xác định)
-db [tên tập tin]
đặt tên tệp cơ sở dữ liệu (mặc định: không xác định)
-swminlen [giá trị]
đặt độ dài căn chỉnh được yêu cầu tối thiểu (đối với căn chỉnh Smith-Waterman) (mặc định: 10)
-swmaxedist [giá trị]
đặt khoảng cách chỉnh sửa tối đa được phép (đối với căn chỉnh Smith-Waterman) (mặc định: 0)
-truy vấn [tên tập tin]
đặt tên tệp truy vấn (mặc định: không xác định)
-Cứu giúp
hiển thị trợ giúp và thoát
-phiên bản
thông tin phiên bản màn hình và thoát
BÁO CÁO GIỎI
Báo cáo lỗi cho[email được bảo vệ]>.
Sử dụng gt-matchtool trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
