Đây là ứng dụng Linux có tên PRIMUS để chạy trong Linux trực tuyến có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên PRIMUS này để chạy trong Linux trực tuyến với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
PRIMUS để chạy trong Linux trực tuyến
Ad
MÔ TẢ
MỚI: Tải xuống phiên bản mới với Tái tạo phả hệ tại primus.gs.washington.eduPhiên bản này đã lỗi thời và không đầy đủ. Vui lòng truy cập trang web mới để có phiên bản hoàn chỉnh của PRIMUS.
Chúng tôi trình bày một phương pháp được điều chỉnh từ lý thuyết đồ thị luôn xác định tập hợp tối đa các cá thể không liên quan trong bất kỳ tập dữ liệu nào và cho phép sử dụng các tham số trọng số trong việc chọn mẫu không liên quan. PRIMUS đọc các ước tính IBD do người dùng tạo và xuất ra tập hợp tối đa có thể có của các cá nhân không liên quan, với một ngưỡng liên quan cụ thể. Thông tin bổ sung để lựa chọn ưu tiên các cá nhân cũng có thể được sử dụng. Ví dụ: khi có hai nhóm cá thể không liên quan với nhau có kích thước tối đa bằng nhau trong một mạng, PRIMUS có thể ưu tiên chọn nhóm có nhiều cá thể bị ảnh hưởng hơn.
Đăng ký danh sách e-mail PRIMUS-Người dùng để biết thông báo về các bản cập nhật và phiên bản mới.
Phần mềm có liên quan:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Tính năng
- Xác định nhóm cá thể không liên quan tối đa từ tập dữ liệu di truyền
- Nhóm các mẫu thành mạng gia đình
- Tạo tệp .dot để trực quan hóa các mạng gia đình
Khán giả
Ngành chăm sóc sức khỏe, Khoa học / Nghiên cứu, Giáo dục
Ngôn ngữ lập trình
Perl
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
