Đây là ứng dụng Linux có tên QUAST có bản phát hành mới nhất có thể được tải xuống dưới dạng quast-5.0.2.tar.gz. Nó có thể được chạy trực tuyến trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks cho máy trạm.
Tải xuống và chạy trực tuyến ứng dụng có tên QUAST này với OnWorks miễn phí.
Làm theo các hướng dẫn sau để chạy ứng dụng này:
- 1. Đã tải ứng dụng này xuống PC của bạn.
- 2. Nhập vào trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 3. Tải lên ứng dụng này trong trình quản lý tệp như vậy.
- 4. Khởi động trình giả lập trực tuyến OnWorks Linux hoặc trình giả lập trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MACOS từ trang web này.
- 5. Từ Hệ điều hành OnWorks Linux mà bạn vừa khởi động, hãy truy cập trình quản lý tệp của chúng tôi https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX với tên người dùng mà bạn muốn.
- 6. Tải xuống ứng dụng, cài đặt và chạy nó.
MÀN HÌNH
Ad
QUÁ
MÔ TẢ
QUAST thực hiện đánh giá chất lượng và so sánh các tập hợp bộ gen nhanh chóng và thuận tiện.
QUAST tính toán một số chỉ số nổi tiếng, bao gồm độ chính xác của đường viền, số lượng gen được phát hiện, N50 và các gen khác, cũng như giới thiệu các chỉ số mới, như NA50 (xem chi tiết trong bài báo và trong sách hướng dẫn). Kết quả phân tích toàn diện trong các bảng tóm tắt (ở định dạng văn bản thuần túy, được phân tách bằng tab và LaTeX) và các ô đầy màu sắc. Công cụ này cũng tạo ra các báo cáo dựa trên web cô đọng tất cả thông tin trong một tệp dễ điều hướng.
QUAST có giao diện dòng lệnh trực quan và sách hướng dẫn chi tiết để giúp người dùng chạy nó và hiểu đầu ra của nó. Hơn nữa, Phòng thí nghiệm đã bắt đầu phiên bản Beta của web-QUAST tại http://quast.bioinf.spbau.ru/ điều này làm cho việc đánh giá chất lượng trở nên đơn giản hơn.
Bài báo QUAST và MetaQUAST (phần mở rộng cho các hội đồng hệ mét) đã được xuất bản trong Bioinformatics.
Tính năng
- báo cáo dựa trên web, bảng ở định dạng txt thuần túy, được phân tách bằng tab và định dạng LaTeX
- đồ thị và biểu đồ đầy màu sắc
- đánh giá chất lượng có và không có bộ gen tham chiếu
- đánh giá chất lượng của các tổ hợp đo lường
- trình duyệt contig tương tác
Khán giả
Khoa học / Nghiên cứu, Nhà phát triển, Người dùng Cuối / Máy tính để bàn
Giao diện người dùng
Dựa trên web, dòng lệnh
Ngôn ngữ lập trình
Python, JavaScript
Danh Mục
Đây là một ứng dụng cũng có thể được tìm nạp từ https://sourceforge.net/projects/quast/. Nó đã được lưu trữ trên OnWorks để có thể chạy trực tuyến một cách dễ dàng nhất từ một trong những Hệ thống hoạt động miễn phí của chúng tôi.
