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dotmatchere - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 dotmatchere

这是 dotmatchere 命令,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

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dotmatcher - 绘制两个序列的阈值点图

概要


点匹配器 -序列 序列 -序列 序列 [-矩阵文件 矩阵]
[-窗口大小 整数[-临界点 整数] -拉紧 切换 -图形 图形
-xygraph xy图

点匹配器 -救命

商品描述


点匹配器 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“对齐:点图”命令组的一部分。

配置


输入 部分
-序列 序列

-序列 序列

-矩阵文件 矩阵
这是比较序列时使用的评分矩阵文件。 默认情况下它是
文件“EBLOSUM62”(用于蛋白质)或文件“EDNAFULL”(用于核酸序列)。 这些
文件位于 EMBOSS 安装的“data”目录中。

额外 部分
-窗口大小 整数
默认值:10

-临界点 整数
默认值:23

输出 部分
-拉紧 切换
显示非比例图形 默认值:N

-图形 图形

-xygraph xy图

使用 onworks.net 服务在线使用 dotmatchere


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