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fastaq-sequence_trim - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 fastaq-sequence_trim

这是命令 fastaq-sequence_trim 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


fastaq_sequence_trim - 在每个字符串的开头修剪给定字符串的精确匹配
序列

商品描述


用法:fastaq_sequence_trim [选项]


从一对序列文件中所有序列的开头修剪序列,只要有
是绝配。 仅当读取对的两个读取至少为一个时才保留读取对
任何修剪后的最小长度

阵地 参数:
infile_1
要修剪的正向 fasta/q 文件的名称

infile_2
要修剪的反向 fasta/q 文件的名称

输出文件_1
输出转发 fasta/q 文件的名称

输出文件_2
输出反向 fasta/q 文件的名称

修剪序列
要在每个输入序列的开头搜索的序列文件的名称

可选 参数:
-h, - 帮帮我
显示此帮助信息并退出

--最小长度 INT
输出序列的最小长度 [50]

--revcomp
如果匹配反向补码,则修剪每个序列的末尾。 这个选项是
用于 PCR 引物修整

使用 onworks.net 服务在线使用 fastaq-sequence_trim


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Linux 命令

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