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mapMers-depth - 云端在线

通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行 mapMers-depth

这是命令 mapMers-depth 可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


mapMers-depth - 报告有关将 kmers 映射到序列的信息

概要


mapMers-深度 {-计数|-深度|-统计} -mers 梅丽尔 -m 梅尔泽 -seq 英法斯塔

配置


模式 of 操作
对于序列序数 's' 和该序列 'p' 中的位置:

-计数 报告从位置 (p) 开始的单个 kmer 的计数 (c)。

格式:'spc'

-深度 报告跨越位置 (p) 的公里数 (n)。

格式:'spn'

-统计 报告跨越的所有 mers 的最小值 (m)、最大值 (M) 和平均值 (a)
位置 (p)。 还报告总计数 (t) 和公里数 (n)

格式:'spm M atn'

总类
-m 梅尔泽

-mers 梅丽尔
梅丽尔(1) 数据库

-seq 英法斯塔
fasta 输入序列

使用 onworks.net 服务在线使用 mapMers-depth


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