这是 picard-tools 命令，可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行，例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器
程序：
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picard-tools - 操作 SAM 和 BAM 文件
概要
皮卡德工具 指挥 [OPTION] ...
商品描述
SAM（序列比对/映射）格式是一种用于存储大核苷酸的通用格式
序列比对。
Picard 工具包括以下用于操作 SAM 和 BAM 文件的实用程序：
添加或替换读取组
巴姆托巴夫克
Bam指数统计
建筑群索引
计算 HsMetrics
清洁山姆
收集AlignmentSummaryMetrics
收集 GcBiasMetrics
收集插入大小指标
收集多个指标
收集TargetedPcrMetrics
收集 RnaSeq 指标
比较SAMs
创建序列字典
下采样山姆
提取Illumina条形码
估计图书馆复杂度
FastqToSam
过滤SamReads
FixMate信息
IlluminaBasecallsToFastq
IlluminaBasecallsToSam
检查Illumina目录
间隔列表工具
标记重复
平均质量按周期
MergeBam对齐
合并文件
合并Vcfs
标准化快速
提取序列
质量得分分布
重新排序山姆
替换SamHeader
回复山姆
Sam格式转换器
SamToFastq
排序山姆
Vcf格式转换器
拆分Vcfs
验证文件
山姆
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版权
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