这是名为 GapFiller 的 Linux 应用程序，其最新版本可以下载为 GapFiller-1.1.1.zip。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。
使用 OnWorks 免费下载并在线运行这个名为 GapFiller 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序：
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统，使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序，安装并运行。
填隙器
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商品描述
GapFiller 是一种种子和扩展本地组装程序，用于填补配对读取中的空白。
它可用于 DNA 和 RNA，并已在 Illumina 数据上进行了测试。
每当要从位于其末端的读数开始组装序列时，都可以使用 GapFiller，提供对序列长度的松散估计。
特性
- 支持的输入格式：FASTQ (.gz, .bz2), FASTA (.gz, .bz2), SAM, BAM
- 高度可定制的装配参数
- 可以为播种和组装指定不同的数据集
- 可以存储布局信息（读取组装重叠群中的位置和方向）
用户界面
命令行
程式语言
C + +中
分类
生物信息学
这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/gapfiller/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中，以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。
