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适用于 Linux 的 QUAST 下载

免费下载 QUAST Linux 应用程序以在 Ubuntu online、Fedora online 或 Debian online 中在线运行

这是名为 QUAST 的 Linux 应用程序,其最新版本可以作为 quast-5.0.2.tar.gz 下载。 它可以在工作站的免费托管服务提供商 OnWorks 中在线运行。

下载并在线运行这个名为 QUAST with OnWorks 的应用程序是免费的。

请按照以下说明运行此应用程序:

- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。

- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。

- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。

- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。

- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。

- 6. 下载应用程序,安装并运行。

SCREENSHOTS

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奎斯特


商品描述

QUAST 对基因组组装进行快速方便的质量评估和比较。

QUAST 计算了许多众所周知的指标,包括重叠群准确度、发现的基因数量、N50 等,以及引入新指标,如 NA50(请参阅论文和手册中的详细信息)。 综合分析产生汇总表(纯文本、制表符分隔和 LaTeX 格式)和彩色绘图。 该工具还生成基于 Web 的报告,将所有信息浓缩到一个易于浏览的文件中。

QUAST 具有直观的命令行界面和详细的手册,可帮助用户运行它并了解其输出。 此外,实验室在 http://quast.bioinf.spbau.ru/ 这使得质量评估更加简单。

QUAST 和 MetaQUAST(宏基因组组装扩展)论文发表在 Bioinformatics 上。



功能

  • 基于网络的报告、纯 txt 表格、制表符分隔和 LaTeX 格式
  • 彩色图和直方图
  • 使用和不使用参考基因​​组的质量评估
  • 宏基因组组装的质量评估
  • 交互式重叠群浏览器


目的

科学/研究、开发人员、最终用户/桌面


用户界面

基于 Web 的命令行


程式语言

蟒蛇,JavaScript


分类

生物信息学、可视化、测试和测量

这是一个也可以从 https://sourceforge.net/projects/quast/ 获取的应用程序。 它已托管在 OnWorks 中,以便从我们的免费操作系统之一以最简单的方式在线运行。


免费服务器和工作站

下载 Windows 和 Linux 应用程序

Linux 命令

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