这是名为 Seurat 的 Linux 应用程序,其最新版本可以下载为 Version5.3.0sourcecode.tar.gz。它可以在免费的工作站托管服务提供商 OnWorks 上在线运行。
免费下载并在线运行这个名为 Seurat 和 OnWorks 的应用程序。
请按照以下说明运行此应用程序:
- 1. 在您的 PC 中下载此应用程序。
- 2. 在我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX 中输入您想要的用户名。
- 3. 在这样的文件管理器中上传这个应用程序。
- 4. 从此网站启动OnWorks Linux online 或Windows online emulator 或MACOS online emulator。
- 5. 从您刚刚启动的 OnWorks Linux 操作系统,使用您想要的用户名转到我们的文件管理器 https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX。
- 6. 下载应用程序,安装并运行。
SCREENSHOTS
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苏拉特
商品描述
Seurat 是由 NYGC 的 Satija 实验室推出的一款用于单细胞基因组学分析的综合 R 工具包。它支持质量控制、标准化、聚类、多模态数据(例如 scRNA-seq、空间、CITE-seq)的整合以及可视化。Seurat v5 引入了可扩展的工作流程和空间转录组学支持,常用于学术界和产业界的单细胞研究。
功能
- scRNA-seq 的质量控制和标准化流程
- 降维、聚类和细胞类型注释
- 跨样本和模式的整合
- 空间转录组学分析与可视化
- 高效处理大规模数据集(v5 可扩展性)
- 丰富的插图、教程以及与 Bioconductor 的集成
程式语言
R
分类
此应用程序也可从 https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/ 获取。它已托管在 OnWorks 中,以便通过我们的免费操作系统以最便捷的方式在线运行。