هذا هو الأمر maskseqe الذي يمكن تشغيله في مزود الاستضافة المجانية OnWorks باستخدام إحدى محطات العمل المجانية المتعددة على الإنترنت مثل Ubuntu Online أو Fedora Online أو محاكي Windows عبر الإنترنت أو محاكي MAC OS عبر الإنترنت
برنامج:
اسم
Maskseq - كتابة تسلسل بمناطق مقنعة
موجز
القناع -تسلسل تسلسل -المناطق نطاق [-لخفض تبديل] -المسكشار سلسلة
-تسق seqout
القناع -مساعدة
الوصف
القناع هو برنامج سطر أوامر من EMBOSS ("البيولوجيا الجزيئية الأوروبية المفتوحة
مجموعة برامج"). إنه جزء من مجموعة (مجموعات) أوامر "التحرير".
OPTIONS
إدخال قسم
-تسلسل تسلسل
مطلوب: قسم
-المناطق نطاق
المناطق المطلوب إخفاءها. يتم تحديد مجموعة من المناطق من خلال مجموعة أزواج من المواضع. ال
المواقف هي أعداد صحيحة. مفصولة بأي حرف غير رقمي وغير ألفا.
أمثلة لمواصفات المنطقة هي: 24-45 ، 56-78 1:45 ، 67 = 99 ؛ 765
1,5,8,10,23,45,57,99
إضافي قسم
-لخفض تبديل
يمكن إخفاء المنطقة عن طريق تحويل أحرف التسلسل إلى أحرف صغيرة ، وبعضها
يمكن للبرامج التي لا تحتوي على نظام EMBOSS ، مثل fasta ، أن تفسر ذلك على أنه منطقة مقنعة. التسلسل
دون تغيير بصرف النظر عن حالة التغيير. قد ترغب في التأكد من أن التسلسل بأكمله
بأحرف كبيرة قبل إخفاء المناطق المحددة بأحرف صغيرة باستخدام
علم "الدعم". القيمة الافتراضية: N
-المسكشار سلسلة
شخصية لاستخدامها عند اخفاء. الافتراضي هو "X" لتسلسل البروتين ، و "N" للنووية
تسلسل. إذا تم تعيين حرف القناع ليكون حرف المسافة أو حرفًا فارغًا ،
ثم يتم إخفاء التسلسل عن طريق تغييره إلى أحرف صغيرة ، تمامًا كما هو الحال مع
علم "-Lowercase". القيمة الافتراضية: @ ($ (acdprotein)؟ X: N)
الناتج قسم
-تسق seqout
استخدم Maskseqe عبر الإنترنت باستخدام خدمات onworks.net
