انگلیسیفرانسویاسپانیایی

اجرای سرورها | Ubuntu > | Fedora > |


فاویکون OnWorks

micro_razers - آنلاین در ابر

micro_razers را در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks از طریق Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا کنید.

این دستور micro_razers است که می تواند در ارائه دهنده میزبانی رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.

برنامه:

نام


میکرو ریزر

خلاصه

میکرو_ریزر [OPTIONS]

شرح

MicroRazerS از یک استراتژی نگاشت مبتنی بر پیشوند برای نقشه برداری از RNA های کوچک احتمالاً استفاده می کند.
حاوی دنباله آداپتور 3.

(ج) حق چاپ 2009 توسط Anne-Katrin Emde.

-h, --کمک

این پیام راهنما را نمایش می دهد.

- نسخه

نمایش اطلاعات نسخه

گزینه های اصلی::

-o, -- خروجی فایل

نام فایل خروجی را تغییر دهید پیش فرض: .نتیجه

-rr, - نرخ شناسایی NUM

نرخ تشخیص درصد را در محدوده [80..100] تنظیم کنید. پیش فرض: 100.

-sL, --طول بذر NUM

طول بذر در محدوده [10..inf]. پیش فرض: 16.

-sE, --seed-error

اجازه یک خطا در دانه را بدهید

-f, --رو به جلو

نقشه فقط برای رشته های رو به جلو خوانده می شود.

-r, --معکوس

نقشه فقط برای معکوس کردن رشته ها می خواند.

-mN, --match-N

"N" با همه شخصیت های دیگر مطابقت دارد

-m, -- حداکثر ضربه NUM

خروجی فقط NUM از بهترین بازدیدها در محدوده [1..inf]. پیش فرض: 100.

-پا, -- پاکسازی - مبهم

پاکسازی با بیش از حداکثر تعداد بهترین مسابقات خوانده می شود

-lm, --حافظه کم

کاهش استفاده از حافظه به قیمت زمان اجرا

-v, -- پرحرف

حالت پرحرف

-vv, --vverbose

حالت بسیار پرمخاطب

گزینه های فرمت خروجی::

-از, --فرمت خروجی NUM

تنظیم فرمت خروجی 0 = فرمت MicroRazerS، 1 = SAM. در محدوده [0..1].

-a, --هم ترازی

تراز را برای هر مسابقه تخلیه کنید

-gn, --نامگذاری ژنوم NUM

نحوه نامگذاری ژنوم ها را انتخاب کنید. 0 = استفاده از Fasta id، 1 = شمارش با 1. In
محدوده [0..1]. پیش فرض: 0.

-rn, --خواندن-نامگذاری NUM

نحوه نام گذاری خوانده ها را انتخاب کنید. 0 = استفاده از Fasta id، 1 = شمارش با 1. In
محدوده [0..1]. پیش فرض: 0.

-بنابراین, -- مرتب سازی NUM

نحوه مرتب شدن مسابقات را انتخاب کنید. 0 = عدد خوانده شده، 1 = موقعیت ژنوم. در محدوده
[0..1]. پیش فرض: 0.

-pf, ---قالب موقعیت NUM

شماره گذاری موقعیت شروع/پایان را انتخاب کنید (به بخش مختصات در زیر مراجعه کنید). 0 = فضای شکاف،
1 = فضای موقعیت در محدوده [0..1]. پیش فرض: 0.

نسخه

نسخه micro_razers: 1.0.1 آخرین به روز رسانی جولای 2009

با استفاده از خدمات onworks.net به صورت آنلاین از micro_razers استفاده کنید


Ad


Ad