Ini adalah perintah maskeqe yang dapat dijalankan di penyedia hosting gratis OnWorks menggunakan salah satu dari beberapa stasiun kerja online gratis kami seperti Ubuntu Online, Fedora Online, emulator online Windows atau emulator online MAC OS
PROGRAM:
NAMA
maskeq - Tulis urutan dengan daerah bertopeng
RINGKASAN
maskeq -urutan urutan -wilayah jarak [-menurunkan toggle] -topeng tali
-outseq urutan
maskeq -bantu
DESKRIPSI
maskeq adalah program baris perintah dari EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paket Perangkat Lunak"). Ini adalah bagian dari grup perintah "Edit".
PILIHAN
Memasukkan bagian
-urutan urutan
Wajib bagian
-wilayah jarak
Daerah untuk disamarkan. Satu set daerah ditentukan oleh satu set pasangan posisi. NS
posisi adalah bilangan bulat. Mereka dipisahkan oleh karakter non-digit, non-alfa.
Contoh spesifikasi wilayah adalah: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
Tambahan bagian
-menurunkan toggle
Wilayah dapat 'ditutupi' dengan mengubah karakter urutan menjadi huruf kecil, beberapa
program non-EMBOSS misalnya fasta dapat menafsirkan ini sebagai wilayah bertopeng. Urutannya adalah
tidak berubah selain dari perubahan kasus. Anda mungkin ingin memastikan bahwa seluruh urutan
dalam huruf besar sebelum menutupi wilayah yang ditentukan menjadi huruf kecil dengan menggunakan
bendera '-makan malam'. Nilai default: N
-topeng tali
Karakter yang digunakan saat masking. Defaultnya adalah 'X' untuk urutan protein, 'N' untuk nukleat
urutan. Jika karakter topeng diatur menjadi karakter SPACE atau karakter null,
kemudian urutannya 'bertopeng' dengan mengubahnya menjadi huruf kecil, seperti halnya
bendera '-huruf kecil'. Nilai default: @($(acdprotein)?X:N)
Keluaran bagian
-outseq urutan
Gunakan maskeqe online menggunakan layanan onworks.net
