ישנם מאגרי תוכנה רשמיים ולא רשמיים שאינם מופעלים בהתקנת ברירת המחדל של Ubuntu. אלה מכילים תוכנות שרבים מוצאים חשיבות ומצפים שיהיו להן. מידע על מאגרים נוספים אלה ניתן למצוא בדף Ubuntu Wiki שכותרתו Ubuntu documentation - Repositories (https://help.ubuntu.com/community/Repositories).