これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドfastaq-caf_to_fastqです。
プログラム:
NAME
fastaq_caf_to_fastq-CAFファイルをFASTQ形式に変換します
DESCRIPTION
使用法:fastaq_caf_to_fastq [オプション]
CAFファイルをFASTQ形式に変換します
ポジショナル 引数:
infile入力CAFファイルの名前。
アウトファイル
出力FASTQファイルの名前
任意 引数:
-h, - 助けて
このヘルプメッセージを表示して終了します
-c, - クリップ
入力CAFファイルに存在する場合は、クリッピング情報を使用して読み取りをクリップします(
フォーム「ClippingQUALstartend」)。 デフォルトではクリップしません
-l INT、 --min_length INT
出力するシーケンスの最小長[1]
onworks.netサービスを使用してfastaq-caf_to_fastqをオンラインで使用する