これは、Ubuntu Online、Fedora Online、Windowsオンラインエミュレーター、MACOSオンラインエミュレーターなどの複数の無料オンラインワークステーションのXNUMXつを使用してOnWorks無料ホスティングプロバイダーで実行できるコマンドmaskseqeです。
プログラム：
NAME
maskseq-マスクされた領域でシーケンスを記述します
SYNOPSIS
マスク配列 -シーケンス シーケンス -地域 範囲 [-下 トグル] -マスク文字 文字列
-outseq セクアウト
マスク配列 -助けて
DESCRIPTION
マスク配列 EMBOSS（「EuropeanMolecular BiologyOpen」のコマンドラインプログラムです。
ソフトウェアスイート」）。 これは、「編集」コマンドグループの一部です。
OPTIONS
入力
-シーケンス シーケンス
必須
-地域 範囲
マスクする領域。 領域のセットは、位置のペアのセットによって指定されます。 NS
位置は整数です。 これらは、数字、英字以外の文字で区切られます。
リージョン仕様の例は次のとおりです：24-45、56-78 1：45、67 = 99; 765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
NEW
-下 トグル
シーケンス文字を小文字に変換することで、領域を「マスク」できます。
非EMBOSSプログラム、例えばfastaは、これをマスクされた領域として解釈できます。 シーケンスは
ケースの変更を除いて変更はありません。 シーケンス全体を確認することをお勧めします
指定された領域を小文字にマスクする前に大文字になります。
'-supper'フラグ。 デフォルト値：N
-マスク文字 文字列
マスキング時に使用する文字。 デフォルトは、タンパク質配列の場合は「X」、核酸の場合は「N」です。
シーケンス。 マスク文字がスペース文字またはヌル文字に設定されている場合、
次に、シーケンスは、と同じように小文字に変更することで「マスク」されます。
'-小文字'フラグ。 デフォルト値：@（$（acdprotein）？X：N）
出力
-outseq セクアウト
onworks.netサービスを使用してオンラインでmaskseqeを使用する
