maskseqe - Online sa Cloud

PROGRAMA:

NAME

maskseq - Sumulat ng isang pagkakasunud-sunod na may mga naka-mask na rehiyon

SINOPSIS

maskseq -pagkakasunod-sunod pagkakasunud-sunod -mga rehiyon saklaw [-babaan toggle] -maskchar pisi
-outseq seqout

maskseq -tulong

DESCRIPTION

maskseq ay isang command line program mula sa EMBOSS (“ang European Molecular Biology Open
Software Suite”). Ito ay bahagi ng (mga) command group na "I-edit".

Opsyon

input seksyon
-pagkakasunod-sunod pagkakasunud-sunod

Kailangan seksyon
-mga rehiyon saklaw
Mga rehiyon na dapat i-mask. Ang isang hanay ng mga rehiyon ay tinukoy ng isang hanay ng mga pares ng mga posisyon. Ang
ang mga posisyon ay mga integer. Ang mga ito ay pinaghihiwalay ng anumang non-digit, non-alpha na character.
Ang mga halimbawa ng mga detalye ng rehiyon ay: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99

karagdagan seksyon
-babaan toggle
Ang rehiyon ay maaaring 'mask' sa pamamagitan ng pag-convert ng mga sequence na character sa lower-case, ang ilan
ang mga programang hindi EMBOSS hal. ang fasta ay maaaring bigyang-kahulugan ito bilang isang nakamaskara na rehiyon. Ang pagkakasunod-sunod ay
hindi nagbabago bukod sa pagbabago ng kaso. Baka gusto mong tiyakin na ang buong sequence
ay nasa upper-case bago i-mask ang mga tinukoy na rehiyon sa lower-case sa pamamagitan ng paggamit ng
bandila ng '-hapunan'. Default na halaga: N

-maskchar pisi
Karakter na gagamitin kapag nagmamaskara. Default ay 'X' para sa mga sequence ng protina, 'N' para sa nucleic
mga pagkakasunod-sunod. Kung ang mask character ay nakatakda sa SPACE character o isang null character,
pagkatapos ay ang sequence ay 'masked' sa pamamagitan ng pagpapalit nito sa lower-case, tulad ng sa
'-maliit na titik' bandila. Default na halaga: @($(acdprotein)?X:N)

Pagbubuhos seksyon
-outseq seqout

Gumamit ng maskseqe online gamit ang mga serbisyo ng onworks.net