Bu, Ubuntu Online, Fedora Online, Windows çevrimiçi emülatörü veya MAC OS çevrimiçi emülatörü gibi birden fazla ücretsiz çevrimiçi iş istasyonumuzdan birini kullanarak OnWorks ücretsiz barındırma sağlayıcısında çalıştırılabilen maskeqe komutudur.
Program:
ADI
maskseq - Maskelenmiş bölgeleri içeren bir dizi yazar
SİNOPSİS
maskeler -sıra dizi -bölgeler menzil [-daha düşük geçiş] -maske karakteri dizi
-outseq takip
maskeler -Yardım
TANIM
maskeler EMBOSS'un (“Avrupa Moleküler Biyoloji Açık
Yazılım Paketi”). "Düzenle" komut grup(lar)ının bir parçasıdır.
SEÇENEKLER
Giriş Bölüm
-sıra dizi
gereklidir Bölüm
-bölgeler menzil
Maskelenecek bölgeler. Bir dizi bölge, bir dizi konum çifti tarafından belirtilir.
pozisyonlar tam sayılardır. Rakam olmayan, alfa olmayan herhangi bir karakterle ayrılırlar.
Bölge belirtim örnekleri şunlardır: 24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
Ek Bölüm
-daha düşük geçiş
Bölge, dizi karakterlerini küçük harfe dönüştürerek 'maskelenebilir', bazıları
EMBOSS olmayan programlar, örneğin fasta, bunu maskelenmiş bir bölge olarak yorumlayabilir. sıra
kasa değişikliği dışında değişmez. Tüm sıranın olduğundan emin olmak isteyebilirsiniz.
kullanarak belirtilen bölgeleri küçük harfle maskelemeden önce büyük harftir.
'-akşam yemeği' bayrağı. Varsayılan değer: N
-maske karakteri dizi
Maskeleme sırasında kullanılacak karakter. Varsayılan, protein dizileri için 'X', nükleik için 'N'dir.
diziler. Maske karakteri BOŞLUK karakteri veya boş karakter olarak ayarlanmışsa,
daha sonra dizi, tıpkı aşağıdaki gibi küçük harfe dönüştürülerek 'maskelenir'
'-küçük harf' bayrağı. Varsayılan değer: @($(acdprotein)?X:N)
Çıktı Bölüm
-outseq takip
Onworks.net hizmetlerini kullanarak maskeqe'yi çevrimiçi kullanın
