Đây là lệnh Maskeqe có thể chạy trong nhà cung cấp dịch vụ lưu trữ miễn phí OnWorks bằng cách sử dụng một trong nhiều máy trạm trực tuyến miễn phí của chúng tôi như Ubuntu Online, Fedora Online, trình mô phỏng trực tuyến Windows hoặc trình mô phỏng trực tuyến MAC OS
CHƯƠNG TRÌNH:
TÊN
Maskeq - Viết một chuỗi với các vùng bị che
SYNOPSIS
mặt nạ -sự nối tiếp trình tự -vùng phạm vi [-tháp bật lên] -mặt nạ chuỗi
-outseq phần tiếp theo
mặt nạ -Cứu giúp
MÔ TẢ
mặt nạ là một chương trình dòng lệnh từ EMBOSS (“Tổ chức Sinh học Phân tử Châu Âu Mở rộng
Bộ phần mềm"). Nó là một phần của (các) nhóm lệnh "Chỉnh sửa".
LỰA CHỌN
Đầu vào phần
-sự nối tiếp trình tự
Yêu cầu phần
-vùng phạm vi
Các khu vực cần che dấu. Một tập hợp các vùng được xác định bởi một tập hợp các cặp vị trí. Các
vị trí là số nguyên. Chúng được phân tách bằng bất kỳ ký tự không phải chữ số, không phải alpha nào.
Ví dụ về thông số kỹ thuật của vùng là: 24-45, 56-78 1:45, 67 = 99; 765..888
1,5,8,10,23,45,57,99
thêm vào phần
-tháp bật lên
Khu vực có thể được 'che dấu' bằng cách chuyển đổi các ký tự trình tự thành chữ thường, một số
các chương trình không phải EMBOSS, ví dụ như fasta có thể hiểu đây là một vùng bị che. Trình tự là
không thay đổi ngoài trường hợp thay đổi. Bạn có thể muốn đảm bảo rằng toàn bộ chuỗi
là chữ hoa trước khi che các vùng được chỉ định thành chữ thường bằng cách sử dụng
cờ '-supper'. Giá trị mặc định: N
-mặt nạ chuỗi
Nhân vật sử dụng khi tạo mặt nạ. Mặc định là 'X' cho trình tự protein, 'N' cho nucleic
trình tự. Nếu ký tự mặt nạ được đặt thành ký tự SPACE hoặc ký tự rỗng,
sau đó trình tự được 'che dấu' bằng cách thay đổi nó thành chữ thường, giống như với
cờ 'chữ hoa'. Giá trị mặc định: @ ($ (acdprotein)? X: N)
Đầu ra phần
-outseq phần tiếp theo
Sử dụng Maskeqe trực tuyến bằng dịch vụ onworks.net
