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maskeqe - 云端在线

在 OnWorks 免费托管服务提供商中通过 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器运行 maskeqe

这是命令 maskeqe,可以使用我们的多个免费在线工作站之一在 OnWorks 免费托管服务提供商中运行,例如 Ubuntu Online、Fedora Online、Windows 在线模拟器或 MAC OS 在线模拟器

程序:

您的姓名


maskeq - 编写一个带有屏蔽区域的序列

概要


掩码 -序列 序列 -地区 范围 [-降低 切换] -掩码字符 绳子
-outseq 序列输出

掩码 -救命

商品描述


掩码 是来自 EMBOSS(“欧洲分子生物学公开赛”)的命令行程序
软件套件”)。 它是“编辑”命令组的一部分。

配置


输入 部分
-序列 序列

其他要求 部分
-地区 范围
要屏蔽的区域。 一组区域由一组位置对指定。 这
位置是整数。 它们由任何非数字、非字母字符分隔。
区域规范的例子是:24-45, 56-78 1:45, 67=99;765..888
1,5,8,10,23,45,57,99

额外 部分
-降低 切换
该区域可以通过将序列字符转换为小写来“屏蔽”,一些
非 EMBOSS 程序(例如 fasta)可以将其解释为屏蔽区域。 顺序是
除了大小写变化外,其他不变。 您可能希望确保整个序列
在将指定区域屏蔽为小写之前使用大写
'-晚餐' 标志。 默认值:N

-掩码字符 绳子
屏蔽时使用的字符。 默认为“X”表示蛋白质序列,“N”表示核酸
序列。 如果掩码字符设置为空格字符或空字符,
然后通过将序列更改为小写来“屏蔽”序列,就像
“-小写”标志。 默认值:@($(acdprotein)?X:N)

输出 部分
-outseq 序列输出

使用 onworks.net 服务在线使用 maskeqe


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